RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515564.5

GATB-212, Transcript of glutamyl-tRNA amidotransferase subunit B, humanhuman

TSL 2

Gene GATB, Length 6,552 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATB-212ENST00000515564 DSCR9P59020 149 aa7.14□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 C3orf56Q8N813 242 aa7.14□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 ZNRF1Q8ND25 227 aa7.14□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 LHFPL5Q8TAF8 219 aa7.14□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa7.14□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa7.14□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 A0A0G2JLM5 398 aa7.14□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 RND2P52198 227 aa7.14□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 PSG9Q00887 426 aa7.14□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 FAM201AQ5SY85 155 aa7.14□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 GTSCR1Q86UQ5 136 aa7.14□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 TMEM204Q9BSN7 226 aa7.14□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa7.14□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 COX5BP10606 129 aa7.13□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 MVDP53602 400 aa7.13□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 DLL3Q9NYJ7 618 aa7.13□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 SSX1Q16384 188 aa7.13□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 WDR73Q6P4I2 378 aa7.13□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 TMEM54Q969K7 222 aa7.13□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 WDYHV1Q96HA8 205 aa7.13□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa7.13□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 TMEM8BA6NDV4 472 aa7.13□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 LINC00869P0C866 280 aa7.13□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 IGHV1-2P23083 117 aa7.13□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 CX3CL1P78423 397 aa7.13□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 PPP1R27Q86WC6 154 aa7.13□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 NEURL2Q9BR09 285 aa7.13□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 DPM3Q9P2X0 92 aa7.13□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa7.13□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 ERVS71-1P61550 626 aa7.13□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa7.13□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 FAM74A4Q5TZK3 123 aa7.13□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 KLHDC1Q8N7A1 406 aa7.13□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 NPVFQ9HCQ7 196 aa7.13□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa7.13□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 C19orf67A6NJJ6 358 aa7.13□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 M0R2Z0 102 aa7.13□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 CD69Q07108 199 aa7.13□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa7.13□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 C12orf54Q6X4T0 127 aa7.13□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 CADM3Q8N126 398 aa7.13□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 JPT1Q9UK76 154 aa7.13□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 S4R3C0 116 aa7.13□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 SNURFLB1AK76 121 aa7.12□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 NPFFO15130 113 aa7.12□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 PAGE4O60829 102 aa7.12□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 MPDU1O75352 247 aa7.12□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 FAM166AQ6J272 317 aa7.12□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 OR2D3Q8NGH3 330 aa7.12□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 SSC4DQ8WTU2 575 aa7.12□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 SLC25A28Q96A46 364 aa7.12□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 OR10C1Q96KK4 312 aa7.12□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 RSG1Q9BU20 258 aa7.12□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 M0R3E3 92 aa7.12□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 IGLV3-19P01714 112 aa7.12□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 DHRS11Q6UWP2 260 aa7.12□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa7.12□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 C5orf52A6NGY3 159 aa7.12□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 EFEMP2O95967 443 aa7.12□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 SSTR5P35346 364 aa7.12□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 ZNF56Q15929 161 aa7.12□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 PRSS8Q16651 343 aa7.12□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 LRRC75AQ8NAA5 344 aa7.12□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 LINC00470Q9BZP3 86 aa7.12□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 DSPPQ9NZW4 1301 aa7.12□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 C4orf51C9J302 202 aa7.12□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 IGHV3-11P01762 117 aa7.12□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 ZNF708P17019 499 aa7.12□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 CD81P60033 236 aa7.12□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 RTN4RL2Q86UN3 420 aa7.12□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 OR10G8Q8NGN5 311 aa7.12□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 TMEM45BQ96B21 275 aa7.12□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 DUX3Q96PT4 197 aa7.12□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 MMP26Q9NRE1 261 aa7.12□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 J3QKU1 62 aa7.12□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 SPNP16150 400 aa7.12□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 HOGA1Q86XE5 327 aa7.12□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 OR1N2Q8NGR9 330 aa7.12□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
GATB-212ENST00000515564 IL36RNQ9UBH0 155 aa7.12□□□□□ -1.27
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