RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442691.6

NR1I3-211, Transcript of nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NR1I3, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3-211ENST00000442691 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa7.46□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 IGHV4-39P01824 125 aa7.46□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 PPIAL4GP0DN37 164 aa7.46□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 IGHV1-8P0DP01 117 aa7.46□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 LYNX1P0DP58 116 aa7.46□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 GPR12P47775 334 aa7.46□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 GNB2P62879 340 aa7.46□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 CLEC2AQ6UVW9 174 aa7.46□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa7.46□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 TP53RKQ96S44 253 aa7.46□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 PIMREGQ9BSJ6 248 aa7.46□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa7.46□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 PKDREJQ9NTG1 2253 aa7.46□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 DSCAMO60469 2012 aa7.45□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 ROS1P08922 2347 aa7.45□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 A0A1B0GU03 582 aa7.45□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 VWC2LB2RUY7 222 aa7.45□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 HSD17B6O14756 317 aa7.45□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 TXNL1O43396 289 aa7.45□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 ENSAO43768 121 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 SLC25A4P12235 298 aa7.45□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 DNASE1P24855 282 aa7.45□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 IL3RAP26951 378 aa7.45□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 THBS3P49746 956 aa7.45□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 ERVFRD-1P60508 538 aa7.45□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 CD300CQ08708 224 aa7.45□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 IL15RAQ13261 267 aa7.45□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 CT45A1Q5HYN5 189 aa7.45□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 AVPI1Q5T686 147 aa7.45□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 TMEM65Q6PI78 240 aa7.45□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 ZNF695Q8IW36 515 aa7.45□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 UXS1Q8NBZ7 420 aa7.45□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 BEND2Q8NDZ0 799 aa7.45□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 OR9G1Q8NH87 305 aa7.45□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 CT45A3Q8NHU0 189 aa7.45□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 FAM168AQ92567 244 aa7.45□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 TMEM186Q96B77 213 aa7.45□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 MBD6Q96DN6 1003 aa7.45□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 S1PR3Q99500 378 aa7.45□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 AIFM2Q9BRQ8 373 aa7.45□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 PDCD10Q9BUL8 212 aa7.45□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 TMEM133Q9H2Q1 129 aa7.45□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 SDHAF2Q9NX18 166 aa7.45□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 COA4Q9NYJ1 87 aa7.45□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 COMMD9Q9P000 198 aa7.45□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 PSG11Q9UQ72 335 aa7.45□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 KPTNQ9Y664 436 aa7.45□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 ABCA4P78363 2273 aa7.45□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 LOC105371242A0A075B767 164 aa7.44□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 C5orf51A6NDU8 294 aa7.44□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 FOXH1O75593 365 aa7.44□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 LY86O95711 162 aa7.44□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 FGF2P09038 288 aa7.44□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 RRASP10301 218 aa7.44□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 LYL1P12980 280 aa7.44□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 SLC25A16P16260 332 aa7.44□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 DUTP33316 252 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 C2orf68Q2NKX9 166 aa7.44□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 NMSQ5H8A3 153 aa7.44□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa7.44□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 DCAF12L2Q5VW00 463 aa7.44□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 TMEM268Q5VZI3 342 aa7.44□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 GGNBP1Q5YKI7 109 aa7.44□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa7.44□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 C5orf24Q7Z6I8 188 aa7.44□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 C11orf42Q8N5U0 333 aa7.44□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 SLC35G3Q8N808 338 aa7.44□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 UBALD1Q8TB05 177 aa7.44□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 C10orf105Q8TEF2 133 aa7.44□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 PCGF1Q9BSM1 259 aa7.44□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 C7orf69Q9H7B7 122 aa7.44□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 PLEKHA2Q9HB19 425 aa7.44□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 ICE1Q9Y2F5 2266 aa7.43□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 FLNCQ14315 2725 aa7.43□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa7.43□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 A8MV72 311 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 FAM90A26D6RGX4 464 aa7.43□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 G3V3Q6 166 aa7.43□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 J3QR06 171 aa7.43□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 NDUFS7O75251 213 aa7.43□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 ADAP1O75689 374 aa7.43□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 LY6HO94772 140 aa7.43□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 IGHV3-43DP0DP04 118 aa7.43□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 MMP9P14780 707 aa7.43□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 CCL3L1P16619 93 aa7.43□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 OMGP23515 440 aa7.43□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 PRTN3P24158 256 aa7.43□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 NFYBP25208 207 aa7.43□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 PSMB6P28072 239 aa7.43□□□□□ -1.22
NR1I3-211ENST00000442691 PRRX1P54821 245 aa7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms