RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436072.6

SFRP4-201, Transcript of secreted frizzled related protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFRP4, Length 2,966 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4-201ENST00000436072 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 NPSP0C0P6 89 aa13.05□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 COL8A2P25067 703 aa13.05□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 IL3RAP26951 378 aa13.05□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 HOXA6P31267 233 aa13.05□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 SSR4P51571 173 aa13.05□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF585BQ52M93 769 aa13.05□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 WDR54Q9H977 334 aa13.05□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 TRAV24A0A0B4J272 114 aa13.05□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 IGLV2-14P01704 120 aa13.05□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 C1QTNF9P0C862 333 aa13.05□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 FOLR3P41439 243 aa13.05□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 GCSAMLQ5JQS6 135 aa13.05□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa13.05□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 OR2Y1Q8NGV0 311 aa13.05□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 PRRG4Q9BZD6 226 aa13.05□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 MSL2Q9HCI7 577 aa13.05□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 NAGKQ9UJ70 344 aa13.05□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 CACNA1HO95180 2353 aa13.04□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF716A6NP11 495 aa13.04□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 RHBDL1O75783 438 aa13.04□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 RAB4BP61018 213 aa13.04□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 IMMP2LQ96T52 175 aa13.04□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa13.04□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 A0A1B0GWJ7 208 aa13.04□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 SIRPB1O00241 398 aa13.04□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 MBP02144 154 aa13.04□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 RAC3P60763 192 aa13.04□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 VASH2Q86V25 355 aa13.04□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 FGFRL1Q8N441 504 aa13.04□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 OR10D3Q8NH80 312 aa13.04□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 DOCK10Q96BY6 2186 aa13.04□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa13.03□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 DNAJC13O75165 2243 aa13.03□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 CTXN2P0C2S0 81 aa13.03□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 G6PCP35575 357 aa13.03□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 TOMM20LQ6UXN7 152 aa13.03□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF114Q8NC26 417 aa13.03□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 ZDHHC16Q969W1 377 aa13.03□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 USF3Q68DE3 2245 aa13.03□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 C11orf94C9JXX5 98 aa13.03□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 RAMP3O60896 148 aa13.03□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 ATP5G3P48201 142 aa13.03□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 PDLIM4P50479 330 aa13.03□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 AGMATQ9BSE5 352 aa13.03□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 TMEM208Q9BTX3 173 aa13.03□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 MANBALQ9NQG1 85 aa13.03□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 DMXL1Q9Y485 3027 aa13.03□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa13.02□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 LINC00205P59089 165 aa13.02□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 ARF1P84077 181 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 SPATA46Q5T0L3 261 aa13.02□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 Q6ZS49 121 aa13.02□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 TMEM9BQ9NQ34 198 aa13.02□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 PAM16Q9Y3D7 125 aa13.02□□□□□ -0.32
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa13.02□□□□□ -0.33
SFRP4-201ENST00000436072 IRF2P14316 349 aa13.02□□□□□ -0.33
SFRP4-201ENST00000436072 THBS3P49746 956 aa13.02□□□□□ -0.33
SFRP4-201ENST00000436072 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
SFRP4-201ENST00000436072 OR1L1Q8NH94 360 aa13.02□□□□□ -0.33
SFRP4-201ENST00000436072 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa13.02□□□□□ -0.33
SFRP4-201ENST00000436072 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
SFRP4-201ENST00000436072 DLL3Q9NYJ7 618 aa13.02□□□□□ -0.33
SFRP4-201ENST00000436072 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa13.02□□□□□ -0.33
SFRP4-201ENST00000436072 NDUFB4O95168 129 aa13.02□□□□□ -0.33
SFRP4-201ENST00000436072 HPRT1P00492 218 aa13.02□□□□□ -0.33
SFRP4-201ENST00000436072 CCKARP32238 428 aa13.02□□□□□ -0.33
SFRP4-201ENST00000436072 PCBD1P61457 104 aa13.02□□□□□ -0.33
SFRP4-201ENST00000436072 CEACAM21Q3KPI0 293 aa13.02□□□□□ -0.33
SFRP4-201ENST00000436072 C1orf194Q5T5A4 169 aa13.02□□□□□ -0.33
SFRP4-201ENST00000436072 KCNIP4Q6PIL6 250 aa13.02□□□□□ -0.33
SFRP4-201ENST00000436072 GGNQ86UU5 652 aa13.02□□□□□ -0.33
SFRP4-201ENST00000436072 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
SFRP4-201ENST00000436072 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa13.02□□□□□ -0.33
SFRP4-201ENST00000436072 GGCTO75223 188 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
SFRP4-201ENST00000436072 CBR3O75828 277 aa13.01□□□□□ -0.33
SFRP4-201ENST00000436072 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa13.01□□□□□ -0.33
SFRP4-201ENST00000436072 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
SFRP4-201ENST00000436072 MCEMP1Q8IX19 187 aa13.01□□□□□ -0.33
SFRP4-201ENST00000436072 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
SFRP4-201ENST00000436072 PARD6AQ9NPB6 346 aa13.01□□□□□ -0.33
SFRP4-201ENST00000436072 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa13.01□□□□□ -0.33
SFRP4-201ENST00000436072 DEGS1O15121 323 aa13.01□□□□□ -0.33
SFRP4-201ENST00000436072 TFPI2P48307 235 aa13.01□□□□□ -0.33
SFRP4-201ENST00000436072 Q0VFX4 171 aa13.01□□□□□ -0.33
SFRP4-201ENST00000436072 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
SFRP4-201ENST00000436072 LOXL2Q9Y4K0 774 aa13.01□□□□□ -0.33
SFRP4-201ENST00000436072 DSPP15924 2871 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
SFRP4-201ENST00000436072 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
SFRP4-201ENST00000436072 TMEM250H0YL14 139 aa13□□□□□ -0.33
SFRP4-201ENST00000436072 ZG16O60844 167 aa13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.3 ms