RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373433.8

RPRD1B-201, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPRD1B, Length 3,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-201ENST00000373433 LAMA1P25391 3075 aa9.55□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 MPPED1O15442 326 aa9.55□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF32P17041 273 aa9.55□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 PLGLAQ15195 96 aa9.55□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 BSXQ3C1V8 233 aa9.55□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF774Q6NX45 483 aa9.55□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 Q96M66 194 aa9.55□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 TBX15Q96SF7 602 aa9.55□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 RBKSQ9H477 322 aa9.55□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 A0A1B0GUS0 222 aa9.55□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 SERPINE2P07093 398 aa9.55□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 PIGYQ3MUY2 71 aa9.55□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa9.55□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 IL22RA2Q969J5 263 aa9.55□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 LYZL4Q96KX0 146 aa9.55□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 DECR2Q9NUI1 292 aa9.55□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 NAGKQ9UJ70 344 aa9.55□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 RAXQ9Y2V3 346 aa9.55□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 A0A1W2PNV4 684 aa9.54□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 TCF21O43680 179 aa9.54□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 RAB35Q15286 201 aa9.54□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 TOMM20LQ6UXN7 152 aa9.54□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 TBC1D26Q86UD7 250 aa9.54□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 OR51H1Q8NH63 302 aa9.54□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 ACY3Q96HD9 319 aa9.54□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 MS4A10Q96PG2 267 aa9.54□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 GTF3C1Q12789 2109 aa9.54□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 FAM87AP0C7U9 286 aa9.54□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 CCKARP32238 428 aa9.54□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 TMEM241Q24JQ0 296 aa9.54□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 PRR7Q8TB68 274 aa9.54□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 DIRC2Q96SL1 478 aa9.54□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 SPRY4Q9C004 299 aa9.54□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 NAT8Q9UHE5 227 aa9.54□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 SIRPB1O00241 398 aa9.54□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 DHRS3O75911 302 aa9.54□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 C1orf194Q5T5A4 169 aa9.54□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 SCCPDHQ8NBX0 429 aa9.54□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 RFESDQ8TAC1 157 aa9.54□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 OR51I2Q9H344 312 aa9.54□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 Q9N2K0 584 aa9.54□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 ATP23Q9Y6H3 246 aa9.54□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 HPRT1P00492 218 aa9.53□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 PPYP01298 95 aa9.53□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 IFNA1P01562 189 aa9.53□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 PFN1P07737 140 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 CRIP3Q6Q6R5 217 aa9.53□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 TMEM170AQ8WVE7 144 aa9.53□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 MOB3AQ96BX8 217 aa9.53□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 TMEM222Q9H0R3 208 aa9.53□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 SPRY3O43610 288 aa9.53□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 CRYAAP02489 173 aa9.53□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 TFPI2P48307 235 aa9.53□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 SSC4DQ8WTU2 575 aa9.53□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 SLC7A10Q9NS82 523 aa9.53□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 PAM16Q9Y3D7 125 aa9.53□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa9.53□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 ENSAO43768 121 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 SRPXP78539 464 aa9.53□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF92Q03936 586 aa9.53□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 BAXQ07812 192 aa9.53□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa9.53□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 OR51G1Q8NGK1 321 aa9.53□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 OR10G4Q8NGN3 311 aa9.53□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa9.53□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 WDR1O75083 606 aa9.52□□□□□ -0.89
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF737O75373 536 aa9.52□□□□□ -0.89
RPRD1B-201ENST00000373433 CA11O75493 328 aa9.52□□□□□ -0.89
RPRD1B-201ENST00000373433 SELEP16581 610 aa9.52□□□□□ -0.89
RPRD1B-201ENST00000373433 WT1P19544 449 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
RPRD1B-201ENST00000373433 CNN1P51911 297 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
RPRD1B-201ENST00000373433 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa9.52□□□□□ -0.89
RPRD1B-201ENST00000373433 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
RPRD1B-201ENST00000373433 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa9.52□□□□□ -0.89
RPRD1B-201ENST00000373433 SSX7Q7RTT5 188 aa9.52□□□□□ -0.89
RPRD1B-201ENST00000373433 OR2T10Q8NGZ9 312 aa9.52□□□□□ -0.89
RPRD1B-201ENST00000373433 OR1F12Q8NHA8 337 aa9.52□□□□□ -0.89
RPRD1B-201ENST00000373433 PP6455Q8WZ26 134 aa9.52□□□□□ -0.89
RPRD1B-201ENST00000373433 LHX4Q969G2 390 aa9.52□□□□□ -0.89
RPRD1B-201ENST00000373433 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
RPRD1B-201ENST00000373433 GPR35Q9HC97 309 aa9.52□□□□□ -0.89
RPRD1B-201ENST00000373433 RNF150Q9ULK6 438 aa9.52□□□□□ -0.89
RPRD1B-201ENST00000373433 MYO15AQ9UKN7 3530 aa9.52□□□□□ -0.89
RPRD1B-201ENST00000373433 M0QZK8 103 aa9.52□□□□□ -0.89
RPRD1B-201ENST00000373433 GGCTO75223 188 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
RPRD1B-201ENST00000373433 RAC2P15153 192 aa9.52□□□□□ -0.89
RPRD1B-201ENST00000373433 CCL1P22362 96 aa9.52□□□□□ -0.89
RPRD1B-201ENST00000373433 OR10J1P30954 320 aa9.52□□□□□ -0.89
RPRD1B-201ENST00000373433 IL24Q13007 206 aa9.52□□□□□ -0.89
RPRD1B-201ENST00000373433 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
RPRD1B-201ENST00000373433 B3GAT1Q9P2W7 334 aa9.52□□□□□ -0.89
RPRD1B-201ENST00000373433 POLQO75417 2590 aa9.52□□□□□ -0.89
RPRD1B-201ENST00000373433 TMEM210A6NLX4 147 aa9.52□□□□□ -0.89
RPRD1B-201ENST00000373433 SIAH2O43255 324 aa9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60 ms