RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318129.5

GINS3-201, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 2,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-201ENST00000318129 GPR137BO60478 399 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 KITLGP21583 273 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 FUT6P51993 359 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 CDSNQ15517 529 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 IQCJQ1A5X6 159 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 GPR157Q5UAW9 335 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 DIRC2Q96SL1 478 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 GPR173Q9NS66 373 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 ABCA12Q86UK0 2595 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 BPNT1O95861 308 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 PDLIM4P50479 330 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 SELENOVP59797 346 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 ERVS71-1P61550 626 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 RBX1P62877 108 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 COL10A1Q03692 680 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 BSPH1Q075Z2 132 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 PSG7Q13046 419 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 ZNF506Q5JVG8 444 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 NCR3LG1Q68D85 454 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 BTNL3Q6UXE8 466 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 OR52N4Q8NGI2 321 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 LINC01560Q8TB33 94 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 NEK7Q8TDX7 302 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 A0A1B0GU03 582 aa8.59□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 ZNF850A8MQ14 1090 aa8.59□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 MBPP02686 304 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 MDKP21741 143 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 RBMXP38159 391 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 PRDX4Q13162 271 aa8.59□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 PLCXD3Q63HM9 321 aa8.59□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 OR10A7Q8NGE5 316 aa8.59□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 OR5A2Q8NGI9 324 aa8.59□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 OR5H2Q8NGV7 314 aa8.59□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 SSC4DQ8WTU2 575 aa8.59□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 BORCS8Q96FH0 119 aa8.59□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 GPER1Q99527 375 aa8.59□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 NICN1Q9BSH3 213 aa8.59□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 FAAP24Q9BTP7 215 aa8.59□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa8.59□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 LPAR2Q9HBW0 351 aa8.59□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 FBLN5Q9UBX5 448 aa8.59□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 HCFC1P51610 2035 aa8.59□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 XKRY2A2RUG3 117 aa8.59□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 TMEM14DPA8MWL7 114 aa8.59□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 CA11O75493 328 aa8.59□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 SCGB1D2O95969 90 aa8.59□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 CD3EP07766 207 aa8.59□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 GRNP28799 593 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 MPV17P39210 176 aa8.59□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 RPL29P47914 159 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 FABP6P51161 128 aa8.59□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 MTCP1P56278 107 aa8.59□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 PRSS12P56730 875 aa8.59□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 KISS1Q15726 138 aa8.59□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 CEACAM21Q3KPI0 293 aa8.59□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 PLAC9Q5JTB6 97 aa8.59□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 ZNF442Q9H7R0 627 aa8.59□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 SRD5A3Q9H8P0 318 aa8.59□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
GINS3-201ENST00000318129 ICE1Q9Y2F5 2266 aa8.58□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 A0A0A6YYD4 124 aa8.58□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 TRDCB7Z8K6 153 aa8.58□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 KNG1P01042 644 aa8.58□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 IFNA21P01568 189 aa8.58□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 IGHV3-13P01766 116 aa8.58□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 OPN1MWP04001 364 aa8.58□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 OPN1MW2P0DN77 364 aa8.58□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 OPN1MW3P0DN78 364 aa8.58□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 IRF2P14316 349 aa8.58□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 BRS3P32247 399 aa8.58□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 TMEM171Q8WVE6 324 aa8.58□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 PLPPR2Q96GM1 343 aa8.58□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 RFNGQ9Y644 331 aa8.58□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 ATP23Q9Y6H3 246 aa8.58□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 FBN2P35556 2912 aa8.58□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 OR5B21A6NL26 309 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 MZT1Q08AG7 82 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 FAM185AQ8N0U4 392 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 OR10G4Q8NGN3 311 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 FAM222BQ8WU58 562 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS3-201ENST00000318129 OR5P3Q8WZ94 311 aa8.57□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms