RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635776.1

SCN1A-210, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SCN1A, Length 10,107 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1A-210ENST00000635776 TXNL1O43396 289 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 CEBPGP53567 150 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 COL10A1Q03692 680 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 C9orf106Q8NAJ2 232 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 TMEM250H0YL14 139 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 TNFSF12O43508 249 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 GLI4P10075 376 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 Q6P435 159 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 MRGPRFQ96AM1 343 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 MALSU1Q96EH3 234 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 MEGF10Q96KG7 1140 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 DOCK11Q5JSL3 2073 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 KRASP01116 189 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 OPN1MWP04001 364 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 CD5P06127 495 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 OPN1MW2P0DN77 364 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 OPN1MW3P0DN78 364 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 GATA4P43694 442 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 TNFRSF9Q07011 255 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 PLEKHA3Q9HB20 300 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 SLC25A15Q9Y619 301 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 NBL1P41271 181 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 BPIFB3P59826 476 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 OR8G2PQ6IF36 304 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 ANAPC16Q96DE5 110 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 SLC45A2Q9UMX9 530 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 SVILO95425 2214 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 ETV3LQ6ZN32 361 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 ZNF429Q86V71 674 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 ZNF488Q96MN9 340 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 NAT8Q9UHE5 227 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 NUP210LQ5VU65 1888 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 UNC13CQ8NB66 2214 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 PPIAL4EA0A075B759 164 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 PPIAL4DF5H284 164 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 PDE6DO43924 150 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 CD3EP07766 207 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 FAM157CP0CG43 387 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 PPIAL4FP0DN26 164 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 BCL2P10415 239 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 AKR1C1Q04828 323 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 DYRK2Q92630 601 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 TMEM167BQ9NRX6 74 aa3.85□□□□□ -1.79
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SCN1A-210ENST00000635776 ZNF727A8MUV8 499 aa3.85□□□□□ -1.79
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SCN1A-210ENST00000635776 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 PMS2P11Q13670 270 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 MOGAT3Q86VF5 341 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 OR13D1Q8NGV5 346 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 TMEM186Q96B77 213 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 CHODLQ9H9P2 273 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 HES4Q9HCC6 221 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 A0A087WWC5 75 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 H7BYZ3 331 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 TMPRSS3P57727 454 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 DLK1P80370 383 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 NHLH2Q02577 135 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 OR4A5Q8NH83 315 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 TNFRSF14Q92956 283 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 CALYQ9NYX4 217 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 HSPB7Q9UBY9 170 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa3.85□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 C7orf77A4D0Y5 90 aa3.84□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 BMP5P22003 454 aa3.84□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 RHOBP62745 196 aa3.84□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 PMP22Q01453 160 aa3.84□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 FAM71F2Q6NXP2 309 aa3.84□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 WDR82Q6UXN9 313 aa3.84□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 WFDC8Q8IUA0 241 aa3.84□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 LURAP1LQ8IV03 231 aa3.84□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 OR10G9Q8NGN4 311 aa3.84□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 OR10G7Q8NGN6 311 aa3.84□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 OR1L6Q8NGR2 347 aa3.84□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 MBD3L1Q8WWY6 194 aa3.84□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP3.84□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa3.84□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 IAPPP10997 89 aa3.84□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 NDUFB7P17568 137 aa3.84□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 NTF4P34130 210 aa3.84□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 STXBP6Q8NFX7 210 aa3.84□□□□□ -1.79
SCN1A-210ENST00000635776 OR5B3Q8NH48 314 aa3.84□□□□□ -1.79
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