RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597718.5

FCHO1-222, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 5

Gene FCHO1, Length 884 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-222	ENST00000597718	CD74	P04233	296 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	ZNF44	P15621	663 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	SERPINA2	P20848	420 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	FBLN7	Q53RD9	439 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	ELP2	Q6IA86	826 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	TMEM104	Q8NE00	496 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-222	ENST00000597718		Q8NFD4	153 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	COQ2	Q96H96	371 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	KCNK15	Q9H427	330 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	C7orf66	A4D0T2	115 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	TMEM235	A6NFC5	223 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	MFNG	O00587	321 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	HSPB6	O14558	160 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	HTR3B	O95264	441 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	RAB3D	O95716	219 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	NAT1	P18440	290 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	TAS2R46	P59540	309 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	ARFRP1	Q13795	201 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	UTF1	Q5T230	341 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	OSR2	Q8N2R0	312 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	CCDC107	Q8WV48	283 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-222	ENST00000597718		Q96M66	194 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	BANF2	Q9H503	90 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	DPM3	Q9P2X0	92 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	ZNF221	Q9UK13	617 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-222	ENST00000597718	ODAM	A1E959	279 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	IFNA6	P05013	189 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	IL5	P05113	134 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	GNB3	P16520	340 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	LMO1	P25800	156 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	OR52W1	Q6IF63	320 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718		Q6P435	159 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718		Q6ZPA2	131 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	TMEM17	Q86X19	198 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	ZNF596	Q8TC21	504 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	OR4F4	Q96R69	305 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	ALG5	Q9Y673	324 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	LEUTX	A8MZ59	168 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	DEGS1	O15121	323 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	SOCS1	O15524	211 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	IGLV1-47	P01700	117 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	CD3D	P04234	171 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	CSN2	P05814	226 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	GLA	P06280	429 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	ECI1	P42126	302 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	CCR6	P51684	374 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	MPV17L	Q2QL34	196 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	CORO2A	Q92828	525 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	PECR	Q9BY49	303 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	MED28	Q9H204	178 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	TOR1A	O14656	332 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	SNAPC5	O75971	98 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	PTHLH	P12272	177 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	DTYMK	P23919	212 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	NFYB	P25208	207 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	BRS3	P32247	399 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	GLP1R	P43220	463 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	TMEM50B	P56557	158 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	CDK10	Q15131	360 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FCHO1-222	ENST00000597718	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		11.25	□□□□□ -0.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.3 ms