RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557261.1

FOXN3-215, Transcript of forkhead box N3, human

TSL 4

Gene FOXN3, Length 625 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FOXN3-215	ENST00000557261	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	CREBBP	Q92793	2442 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	PLCE1	Q9P212	2302 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261		A0A1W2PPI3	338 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261		A0A1W2PR80	420 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	MEIOC	A2RUB1	952 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	FUOM	A2VDF0	154 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	C7orf66	A4D0T2	115 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	TMEM235	A6NFC5	223 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261		M0R1B8	84 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	CCL21	O00585	134 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	IGKV1D-12	P01611	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	CD55	P08174	381 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	PGA5	P0DJD9	388 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	SERPINA2	P20848	420 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	MPV17	P39210	176 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	KCNJ3	P48549	501 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	VEGFC	P49767	419 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	BCAP31	P51572	246 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	GPM6A	P51674	278 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	TMEM50B	P56557	158 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	TAS2R46	P59540	309 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	GNG2	P59768	71 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	TFF3	Q07654	80 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	LY6D	Q14210	128 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	ZNF146	Q15072	292 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	OR10K2	Q6IF99	312 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	GAPT	Q8N292	157 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	POC1A	Q8NBT0	407 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	ACBD4	Q8NC06	268 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	OR56B4	Q8NH76	319 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	RNF170	Q96K19	258 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	PRRT1	Q99946	306 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	NICN1	Q9BSH3	213 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	TMEM100	Q9NV29	134 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	RASL12	Q9NYN1	266 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	KLK11	Q9UBX7	282 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	MIOX	Q9UGB7	285 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	NBAS	A2RRP1	2371 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261		A0A1B0GVG6	124 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	PLSCR5	A0PG75	271 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	CHEK1	O14757	476 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	SOCS1	O15524	211 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	SAP30	O75446	220 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	NDUFB6	O95139	128 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	FSTL3	O95633	263 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	DHFR	P00374	187 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	FUT3	P21217	361 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	CA6	P23280	308 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	HLA-DMA	P28067	261 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	ZNF83	P51522	516 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	ERVS71-1	P61550	626 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	BSPH1	Q075Z2	132 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	ZNF154	Q13106	437 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	CDK10	Q15131	360 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	OR8G1	Q15617	311 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	CDNF	Q49AH0	187 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	BEX5	Q5H9J7	111 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	WDR86	Q86TI4	376 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FOXN3-215	ENST00000557261	HOGA1	Q86XE5	327 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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