RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	FAM25G	B3EWG6	89 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	TRDC	B7Z8K6	153 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	RGS5	O15539	181 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	IGLV1-47	P01700	117 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	HLA-DQB1	P01920	261 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	PF4V1	P10720	104 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	GNG2	P59768	71 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	HLA-DRB3	P79483	266 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	HTD2	P86397	168 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222		Q6ZS49	121 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	LAX1	Q8IWV1	398 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	MCFD2	Q8NI22	146 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	PSG11	Q9UQ72	335 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	ARG1	P05089	322 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	SCT	P09683	121 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	PTHLH	P12272	177 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	MNDA	P41218	407 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	BLCAP	P62952	87 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222		Q3ZCU0	254 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	STEAP3	Q658P3	488 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	C11orf88	Q6PI97	169 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	OR9G1	Q8NH87	305 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	MUC7	Q8TAX7	377 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	ZNF596	Q8TC21	504 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	LEAP2	Q969E1	77 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	GNG12	Q9UBI6	72 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	LYST	Q99698	3801 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222		J3QR06	171 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	TPPP	O94811	219 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	IGHV3-7	P01780	117 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	PF4	P02776	101 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	PRRX1	P54821	245 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	LGALS4	P56470	323 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	GNMT	Q14749	295 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	KIR2DS1	Q14954	304 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	MORN2	Q502X0	79 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	CNIH2	Q6PI25	160 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	JPT1	Q9UK76	154 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	TOR1A	O14656	332 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	FABP7	O15540	132 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	YPEL1	O60688	119 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	DIRAS3	O95661	229 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	HTR1D	P28221	377 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	PRSS3	P35030	304 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	CBX5	P45973	191 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	CD83	Q01151	205 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	LINC00311	Q8N616	119 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	YPEL2	Q96QA6	119 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	LY6L	H3BQJ8	138 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	GSTT2	P0CG29	244 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	GSTT2B	P0CG30	244 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	ZBTB25	P24278	435 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	TNFSF8	P32971	234 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	GNG10	P50151	68 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	ZNF134	P52741	427 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	IGSF11	Q5DX21	431 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-231	ENST00000552222	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	10.97	□□□□□ -0.65

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