RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550379.1

RNF41-208, Transcript of ring finger protein 41, human

TSL 3

Gene RNF41, Length 525 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF41-208	ENST00000550379	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	MMP26	Q9NRE1	261 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	GNG12	Q9UBI6	72 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	ZNF69	Q9UC07	566 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	ZNF221	Q9UK13	617 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	VGLL3	A8MV65	326 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	GPR31	O00270	319 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	BET1	O15155	118 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	RPA2	P15927	270 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	AADAC	P22760	399 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	S100G	P29377	79 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	DYNLT3	P51808	116 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	ARHGDIB	P52566	201 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	HERV-K104	P61576	105 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	MADCAM1	Q13477	382 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	C11orf88	Q6PI97	169 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	OR8H3	Q8N146	312 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	RFESD	Q8TAC1	157 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	ENKUR	Q8TC29	256 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	IL22RA2	Q969J5	263 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	MALSU1	Q96EH3	234 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	TBX15	Q96SF7	602 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	RNF5	Q99942	180 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	MCUB	Q9NWR8	336 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	TNC	P24821	2201 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	HIVEP2	P31629	2446 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	FAM172BP	A6NC97	362 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	RNF212B	A8MTL3	300 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	RNF223	E7ERA6	249 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	MPPED1	O15442	326 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	CD5L	O43866	347 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	TOX4	O94842	621 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	DHFR	P00374	187 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	F2R	P25116	425 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	IL3RA	P26951	378 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	CEACAM3	P40198	252 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	CCR6	P51684	374 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	ARF6	P62330	175 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	SRPX	P78539	464 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	LCN2	P80188	198 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	EBI3	Q14213	229 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	POU2AF1	Q16633	256 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	TRIM16L	Q309B1	348 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	DRAM1	Q8N682	238 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	DDB2	Q92466	427 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	S1PR3	Q99500	378 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	NUDT15	Q9NV35	164 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	DPM3	Q9P2X0	92 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	VSIG4	Q9Y279	399 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	AUP1	Q9Y679	476 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	DBX1	A6NMT0	343 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	LEUTX	A8MZ59	168 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	ST8SIA5	O15466	376 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	CDS2	O95674	445 aa		6.24	□□□□□ -1.41

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