RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533179.1

SOX9-AS1-211, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 460 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-211ENST00000533179 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa5.88□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 R4GN57 208 aa5.88□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa5.87□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa5.87□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PRR32B1ATL7 298 aa5.87□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SLC2A10O95528 541 aa5.87□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CD14P08571 375 aa5.87□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 IGLC1P0CG04 106 aa5.87□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CXCL3P19876 107 aa5.87□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GPD1P21695 349 aa5.87□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KIR2DS2P43631 304 aa5.87□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TAF6P49848 677 aa5.87□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FABP6P51161 128 aa5.87□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TPPP2P59282 170 aa5.87□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa5.87□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PHLDA2Q53GA4 152 aa5.87□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RAB6CQ53S08 254 aa5.87□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ALKAL2Q6UX46 152 aa5.87□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF550Q7Z398 422 aa5.87□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SPATA3Q8NHX4 192 aa5.87□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 Q8TCH9 128 aa5.87□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RAB6CQ9H0N0 254 aa5.87□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 BANF2Q9H503 90 aa5.87□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ASF1BQ9NVP2 202 aa5.87□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KLK11Q9UBX7 282 aa5.87□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MED31Q9Y3C7 131 aa5.87□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa5.87□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PIK3C2AO00443 1686 aa5.87□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PEAK1Q9H792 1746 aa5.87□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OTOFQ9HC10 1997 aa5.86□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MYH6P13533 1939 aa5.86□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa5.86□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 A0A1B0GTL3 188 aa5.86□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DHRS12A0PJE2 317 aa5.86□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MYBPHLA2RUH7 354 aa5.86□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 K7EMT4 169 aa5.86□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NPFFO15130 113 aa5.86□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 BCL2L11O43521 198 aa5.86□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF728P0DKX0 622 aa5.86□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CPMP14384 443 aa5.86□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF549Q6P9A3 640 aa5.86□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa5.86□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR2M3Q8NG83 312 aa5.86□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PSMF1Q92530 271 aa5.86□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ARPC1AQ92747 370 aa5.86□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 STARD4Q96DR4 205 aa5.86□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GGTLC1Q9BX51 225 aa5.86□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SELENOIQ9C0D9 397 aa5.86□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 WDR13Q9H1Z4 485 aa5.86□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa5.86□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RPRMQ9NS64 109 aa5.86□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa5.86□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RIMS3Q9UJD0 308 aa5.86□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C7orf71A4D174 169 aa5.85□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 B4DEV8 164 aa5.85□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RFXAPO00287 272 aa5.85□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FGF17O60258 216 aa5.85□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LGALS2P05162 132 aa5.85□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LINC00694P0DN24 101 aa5.85□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LIFP15018 202 aa5.85□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CXCL2P19875 107 aa5.85□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 APOC4P55056 127 aa5.85□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CX3CL1P78423 397 aa5.85□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FAM27E3Q08E93 113 aa5.85□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMEM183BQ1AE95 376 aa5.85□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 VAX1Q5SQQ9 334 aa5.85□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FAM201AQ5SY85 155 aa5.85□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FHL5Q5TD97 284 aa5.85□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TSPO2Q5TGU0 170 aa5.85□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OLFML2AQ68BL7 652 aa5.85□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 Q6ZRM9 215 aa5.85□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C9orf139Q6ZV77 190 aa5.85□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMEM150AQ86TG1 271 aa5.85□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KLHDC1Q8N7A1 406 aa5.85□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 STPG4Q8N801 248 aa5.85□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR2T27Q8NH04 317 aa5.85□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NEIL3Q8TAT5 605 aa5.85□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CT55Q8WUE5 264 aa5.85□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FMC1Q96HJ9 113 aa5.85□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PKMYT1Q99640 499 aa5.85□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PITX2Q99697 317 aa5.85□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HIST1H2BLQ99880 126 aa5.85□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DPY30Q9C005 99 aa5.85□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 JPT2Q9H910 190 aa5.85□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FZD1Q9UP38 647 aa5.85□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FRMPD3Q5JV73 1810 aa5.85□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-211ENST00000533179 A0A0D9SG52 128 aa5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 383.2 ms