RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC25A42Q86VD7 318 aa6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LDLRAD3Q86YD5 345 aa6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SGPP2Q8IWX5 399 aa6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LINC00311Q8N616 119 aa6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DRAM1Q8N682 238 aa6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF645Q8N7E2 425 aa6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C8orf31Q8N9H6 132 aa6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZBTB34Q8NCN2 500 aa6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF596Q8TC21 504 aa6.94□□□□□ -1.3
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 S1PR3Q99500 378 aa6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AGMATQ9BSE5 352 aa6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IFI27L2Q9H2X8 130 aa6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C5orf66Q9H5L9 145 aa6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PIPOXQ9P0Z9 390 aa6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa6.94□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa6.93□□□□□ -1.3
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 J3QLI3 93 aa6.93□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 M0R1X1 148 aa6.93□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MPPED1O15442 326 aa6.93□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 VSIG10L2P0DP72 767 aa6.93□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MMP9P14780 707 aa6.93□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 VAMP1P23763 118 aa6.93□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UBE2E1P51965 193 aa6.93□□□□□ -1.3
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LGALS4P56470 323 aa6.93□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HCP5Q6MZN7 132 aa6.93□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TBC1D26Q86UD7 250 aa6.93□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BEND2Q8NDZ0 799 aa6.93□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BVESQ8NE79 360 aa6.93□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR11H6Q8NGC7 330 aa6.93□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CAPSLQ8WWF8 208 aa6.93□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TNFRSF14Q92956 283 aa6.93□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GPHA2Q96T91 129 aa6.93□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GHITMQ9H3K2 345 aa6.93□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC2A9Q9NRM0 540 aa6.93□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SDHAF2Q9NX18 166 aa6.93□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GAB2Q9UQC2 676 aa6.93□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LRBAP50851 2863 aa6.93□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RNF212BA8MTL3 300 aa6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LEUTXA8MZ59 168 aa6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa6.92□□□□□ -1.3
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGLV2-14P01704 120 aa6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IL5P05113 134 aa6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR4E1P0C645 316 aa6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ANXA3P12429 323 aa6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EPHA1P21709 976 aa6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HTR1DP28221 377 aa6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CEACAM3P40198 252 aa6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 REG1BP48304 166 aa6.92□□□□□ -1.3
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CBX3Q13185 183 aa6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PPP1R1AQ13522 171 aa6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC9A3R2Q15599 337 aa6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MSMO1Q15800 293 aa6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HLA-DRB5Q30154 266 aa6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SP6Q3SY56 376 aa6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM128Q5BJH2 165 aa6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GPR157Q5UAW9 335 aa6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF626Q68DY1 528 aa6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF66Q6ZN08 573 aa6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 Q6ZNX1 250 aa6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ODF3L1Q8IXM7 274 aa6.92□□□□□ -1.3
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR51H1Q8NH63 302 aa6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CASTOR1Q8WTX7 329 aa6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM230Q96A57 120 aa6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SEC22CQ9BRL7 303 aa6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NAA60Q9H7X0 242 aa6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DPM3Q9P2X0 92 aa6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ALG5Q9Y673 324 aa6.92□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A0A6YYJ9 748 aa6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C9orf170A2RU37 121 aa6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ODF3BA8MYP8 253 aa6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NPFFO15130 113 aa6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SSNA1O43805 119 aa6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SFT2D2O95562 160 aa6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IFNA2P01563 188 aa6.91□□□□□ -1.3
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