RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	CALHM1	Q8IU99	346 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	GLRX2	Q9NS18	164 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	IL17B	Q9UHF5	180 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193		H0YIZ8	118 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF253	O75346	499 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	PAX6	P26367	422 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	PRDX2	P32119	198 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	COL10A1	Q03692	680 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	RND1	Q92730	232 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	POM121	Q96HA1	1249 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	ZIC3	O60481	467 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	CLDN14	O95500	239 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	LRP11	Q86VZ4	500 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	GDF15	Q99988	308 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	RNF126	Q9BV68	326 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	DOCK9	Q9BZ29	2069 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1W2PRD5	423 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1W2PRF3	423 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1W2PRM7	423 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	SLC31A2	O15432	143 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	APELA	P0DMC3	54 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	GAMT	Q14353	236 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	RHOV	Q96L33	236 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF735	P0CB33	412 aa		6.91	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	CD1B	P29016	333 aa		6.91	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	OR5I1	Q13606	314 aa		6.91	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		6.91	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	LINC00596	Q86U02	117 aa		6.91	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		6.91	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	RPE	Q96AT9	228 aa		6.91	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		6.91	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		6.91	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		6.91	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		6.91	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	MYLK	Q15746	1914 aa		6.91	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	NDUFB4	O95168	129 aa		6.91	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	IGLV3-19	P01714	112 aa		6.91	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	6.91	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	REG1B	P48304	166 aa		6.91	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	6.91	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	6.91	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	VAMP3	Q15836	100 aa		6.91	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		6.91	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		6.91	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM54	Q969K7	222 aa		6.91	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	RPRM	Q9NS64	109 aa		6.91	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		6.91	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	6.91	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		6.91	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		6.91	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		6.91	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		6.91	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		6.91	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		6.91	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		6.91	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		6.91	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		6.91	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		6.91	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	NKX2-8	O15522	239 aa		6.91	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	CELA3A	P09093	270 aa		6.91	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		6.91	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		6.91	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		6.91	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		6.91	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	KIR2DS2	P43631	304 aa		6.91	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	6.91	□□□□□ -1.3
NEK1-208	ENST00000512193	CFHR1	Q03591	330 aa		6.91	□□□□□ -1.3

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