RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495787.1

ECHDC3-204, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene ECHDC3, Length 505 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-204ENST00000495787 B3GALNT1O75752 331 aa8.86□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 F12P00748 615 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 OR8U9P0C7N5 309 aa8.86□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 IGHV3-43DP0DP04 118 aa8.86□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 CDKN1AP38936 164 aa8.86□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 EFNA4P52798 201 aa8.86□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM33P57088 247 aa8.86□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 LOXL3P58215 753 aa8.86□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 RPL31P62899 125 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 SRPXP78539 464 aa8.86□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 MORN2Q502X0 79 aa8.86□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 CLEC9AQ6UXN8 241 aa8.86□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 GSG1LQ6UXU4 331 aa8.86□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 LGI3Q8N145 548 aa8.86□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF645Q8N7E2 425 aa8.86□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 WFDC11Q8NEX6 87 aa8.86□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 OR52M1Q8NGK5 317 aa8.86□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 OR8U1Q8NH10 309 aa8.86□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 SPATA3Q8NHX4 192 aa8.86□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 GLYATL2Q8WU03 294 aa8.86□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa8.86□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa8.86□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 GFOD1Q9NXC2 390 aa8.86□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa8.86□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 PRR13Q9NZ81 148 aa8.86□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 GNG12Q9UBI6 72 aa8.86□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 MIOXQ9UGB7 285 aa8.86□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 KCNS2Q9ULS6 477 aa8.86□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa8.85□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 C5orf51A6NDU8 294 aa8.85□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 G3V3Q6 166 aa8.85□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 H0Y980 276 aa8.85□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 CCSO14618 274 aa8.85□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 GPR37O15354 613 aa8.85□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 PPIHO43447 177 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 LY6HO94772 140 aa8.85□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 IGLV2-14P01704 120 aa8.85□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 F2RP25116 425 aa8.85□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 CYCSP99999 105 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 LTC4SQ16873 150 aa8.85□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 SP6Q3SY56 376 aa8.85□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 AVPI1Q5T686 147 aa8.85□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 PRIMA1Q86XR5 153 aa8.85□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 DRAM1Q8N682 238 aa8.85□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 IGFBPL1Q8WX77 278 aa8.85□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 TP53RKQ96S44 253 aa8.85□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 PDCD10Q9BUL8 212 aa8.85□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM222Q9H0R3 208 aa8.85□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 OR2D2Q9H210 308 aa8.85□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 C19orf12Q9NSK7 152 aa8.85□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 COL6A5A8TX70 2615 aa8.85□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 DOCK11Q5JSL3 2073 aa8.85□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 STAB1Q9NY15 2570 aa8.84□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa8.84□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa8.84□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 RNF212BA8MTL3 300 aa8.84□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 FAM25EA8MYX2 175 aa8.84□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 ADAP1O75689 374 aa8.84□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 IFNA21P01568 189 aa8.84□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 HOXB5P09067 269 aa8.84□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 UCP1P25874 307 aa8.84□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 RAB7AP51149 207 aa8.84□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 FGL1Q08830 312 aa8.84□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF273Q14593 569 aa8.84□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 DEFB113Q30KQ7 82 aa8.84□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM200BQ69YZ2 307 aa8.84□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF841Q6ZN19 808 aa8.84□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 OR8B3Q8NGG8 313 aa8.84□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 C2orf50Q96LR7 162 aa8.84□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM56Q96MV1 263 aa8.84□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF714Q96N38 554 aa8.84□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 OR8B2Q96RD0 313 aa8.84□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 NMES1Q9C002 83 aa8.84□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 RNF150Q9ULK6 438 aa8.84□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 PSG11Q9UQ72 335 aa8.84□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 GAB2Q9UQC2 676 aa8.84□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa8.84□□□□□ -0.99
ECHDC3-204ENST00000495787 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa8.83□□□□□ -1
ECHDC3-204ENST00000495787 ST8SIA5O15466 376 aa8.83□□□□□ -1
ECHDC3-204ENST00000495787 TNFSF12O43508 249 aa8.83□□□□□ -1
ECHDC3-204ENST00000495787 SNAPC5O75971 98 aa8.83□□□□□ -1
ECHDC3-204ENST00000495787 OMGP23515 440 aa8.83□□□□□ -1
ECHDC3-204ENST00000495787 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
ECHDC3-204ENST00000495787 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
ECHDC3-204ENST00000495787 Q3ZCU0 254 aa8.83□□□□□ -1
ECHDC3-204ENST00000495787 Q5BKY6 102 aa8.83□□□□□ -1
ECHDC3-204ENST00000495787 GGNBP1Q5YKI7 109 aa8.83□□□□□ -1
ECHDC3-204ENST00000495787 HEPN1Q6WQI6 88 aa8.83□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms