RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477086.5

MUC4-216, Transcript of mucin 4, cell surface associated, human

TSL 5

Gene MUC4, Length 16,353 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC4-216	ENST00000477086	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	SYT8	Q8NBV8	401 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	ASPDH	A6ND91	283 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086		A0A1B0GW64	132 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086		H3BP45	60 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	TMEM189	A5PLL7	270 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	C17orf51	A8MQB3	221 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	HKR1	P10072	659 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	OR10D3	Q8NH80	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	GDF15	Q99988	308 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086		A0A0G2JMM0	328 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086		A0A1W2PPB8	328 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	HBB	P68871	147 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	EPPIN	O95925	133 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	IGFBP4	P22692	258 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	FAM53B	Q14153	422 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	KLK2	P20151	261 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	PTGER1	P34995	402 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086		A8MWV9	139 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	NDUFB4	O95168	129 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	TMEM50A	O95807	157 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	TM4SF1	P30408	202 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	UMOD	P07911	640 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	MC5R	P33032	325 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	OR3A4P	P47883	348 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	PLXNA2	O75051	1894 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	SELENOT	P62341	195 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086		A0A1B0GWJ7	208 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	HYPM	O75409	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	CT83	Q5H943	113 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	CA7	P43166	264 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	CYB561	P49447	251 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	BATF2	Q8N1L9	274 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	C5orf49	A4QMS7	147 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086		H0YL77	283 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086		K7ESF4	209 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	FST	P19883	344 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	HSD52	Q0P140	79 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	C14orf144	Q96I85	54 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	GAGE12B	A1L429	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086		A0A1B0GTH9	108 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	INSL4	Q14641	139 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	MFRP	Q9BY79	579 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086		H7C2G1	150 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	PPY	P01298	95 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	TMEM186	Q96B77	213 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-216	ENST00000477086	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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