RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC107Q8WV48 283 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 DYRK2Q92630 601 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 LINC00574Q9H8X3 128 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 RAB9BQ9NP90 201 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 CALYQ9NYX4 217 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A0A6YYH2 397 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 A6NJ64 397 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 POM121CA8CG34 1229 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 CFDP00746 253 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 CXCL3P19876 107 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 FPR2P25090 351 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 S100PP25815 95 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 UBE2E1P51965 193 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 C17orf58Q2M2W7 97 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 OR10A7Q8NGE5 316 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 OR13D1Q8NGV5 346 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 OR4K15Q8NH41 348 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC25A38Q96DW6 304 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 CMTM3Q96MX0 182 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 PDCD10Q9BUL8 212 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 AK3Q9UIJ7 227 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 TRAV39A0A0B4J263 110 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 SERPINE3A8MV23 424 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 NAPSAO96009 420 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 EPHA1P21709 976 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 CDK2P24941 298 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 UBE2NLQ5JXB2 153 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 C9orf139Q6ZV77 190 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 KCNIP1Q9NZI2 227 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 ANK2Q01484 3957 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGEF1-205ENST00000450873 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa8.65□□□□□ -1.03
RABGEF1-205ENST00000450873 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
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RABGEF1-205ENST00000450873 CD3GP09693 182 aa8.65□□□□□ -1.03
RABGEF1-205ENST00000450873 GNB3P16520 340 aa8.65□□□□□ -1.03
RABGEF1-205ENST00000450873 DLX1P56177 255 aa8.65□□□□□ -1.03
RABGEF1-205ENST00000450873 OPCMLQ14982 345 aa8.65□□□□□ -1.03
RABGEF1-205ENST00000450873 CDNFQ49AH0 187 aa8.65□□□□□ -1.03
RABGEF1-205ENST00000450873 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa8.65□□□□□ -1.03
RABGEF1-205ENST00000450873 MOB1BQ7L9L4 216 aa8.65□□□□□ -1.03
RABGEF1-205ENST00000450873 RTN4RL2Q86UN3 420 aa8.65□□□□□ -1.03
RABGEF1-205ENST00000450873 SAMD12Q8N8I0 201 aa8.65□□□□□ -1.03
RABGEF1-205ENST00000450873 ARL11Q969Q4 196 aa8.65□□□□□ -1.03
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM133Q9H2Q1 129 aa8.65□□□□□ -1.03
RABGEF1-205ENST00000450873 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP8.65□□□□□ -1.03
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RABGEF1-205ENST00000450873 SPINT2O43291 252 aa8.64□□□□□ -1.03
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RABGEF1-205ENST00000450873 PRAF2O60831 178 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-205ENST00000450873 MMP23AO75900 390 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-205ENST00000450873 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
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RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF880Q6PDB4 577 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-205ENST00000450873 PDZD9Q8IXQ8 264 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-205ENST00000450873 PNKDQ8N490 385 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-205ENST00000450873 OR56B4Q8NH76 319 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-205ENST00000450873 CYYR1Q96J86 154 aa8.64□□□□□ -1.03
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RABGEF1-205ENST00000450873 C12orf77C9JDV5 145 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-205ENST00000450873 NPFFO15130 113 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-205ENST00000450873 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
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RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM30BQ3MIR4 351 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-205ENST00000450873 MIDNQ504T8 468 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-205ENST00000450873 BRD3OSQ6XYD6 125 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-205ENST00000450873 BVESQ8NE79 360 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-205ENST00000450873 OR11H6Q8NGC7 330 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-205ENST00000450873 OR52M1Q8NGK5 317 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-205ENST00000450873 OR2T35Q8NGX2 323 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-205ENST00000450873 RFESDQ8TAC1 157 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-205ENST00000450873 KIRREL1Q96J84 757 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-205ENST00000450873 SUCNR1Q9BXA5 334 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-205ENST00000450873 OR51M1Q9H341 326 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-205ENST00000450873 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-205ENST00000450873 TAF9BQ9HBM6 251 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-205ENST00000450873 TRAV18A0A075B6X5 111 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A087X0M5 115 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A1B0GX30 115 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-205ENST00000450873 XRCC3O43542 346 aa8.63□□□□□ -1.03
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