RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382998.8

CTIF-202, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 4,407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-202ENST00000382998 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
CTIF-202ENST00000382998 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa11.96□□□□□ -0.49
CTIF-202ENST00000382998 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa11.96□□□□□ -0.49
CTIF-202ENST00000382998 TIGITQ495A1 244 aa11.96□□□□□ -0.49
CTIF-202ENST00000382998 PMS2CLQ68D20 193 aa11.96□□□□□ -0.49
CTIF-202ENST00000382998 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
CTIF-202ENST00000382998 BRICD5Q6PL45 260 aa11.96□□□□□ -0.49
CTIF-202ENST00000382998 ZNF841Q6ZN19 808 aa11.96□□□□□ -0.49
CTIF-202ENST00000382998 ZNF595Q8IYB9 648 aa11.96□□□□□ -0.49
CTIF-202ENST00000382998 PMCHL2Q9BQD1 86 aa11.96□□□□□ -0.49
CTIF-202ENST00000382998 OTOFQ9HC10 1997 aa11.96□□□□□ -0.49
CTIF-202ENST00000382998 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
CTIF-202ENST00000382998 SPTBP11277 2137 aa11.96□□□□□ -0.49
CTIF-202ENST00000382998 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa11.96□□□□□ -0.49
CTIF-202ENST00000382998 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa11.96□□□□□ -0.49
CTIF-202ENST00000382998 RNF222A6NCQ9 220 aa11.96□□□□□ -0.49
CTIF-202ENST00000382998 CEACAM4O75871 244 aa11.96□□□□□ -0.49
CTIF-202ENST00000382998 IGHA2P01877 340 aa11.96□□□□□ -0.49
CTIF-202ENST00000382998 TMEM225BP0DP42 221 aa11.96□□□□□ -0.49
CTIF-202ENST00000382998 FAM71E1Q6IPT2 247 aa11.96□□□□□ -0.49
CTIF-202ENST00000382998 LINC00346Q8IVM7 164 aa11.96□□□□□ -0.49
CTIF-202ENST00000382998 KIR2DL5AQ8N109 375 aa11.96□□□□□ -0.49
CTIF-202ENST00000382998 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
CTIF-202ENST00000382998 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
CTIF-202ENST00000382998 LOC285556D6RIA3 1793 aa11.96□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 EFEMP2O95967 443 aa11.96□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 Q1RN00 199 aa11.96□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 C9orf153Q5TBE3 101 aa11.96□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 FAM219AQ8IW50 185 aa11.96□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 GPR35Q9HC97 309 aa11.96□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 NRN1Q9NPD7 142 aa11.96□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 GPR132Q9UNW8 380 aa11.96□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 SERF1AO75920 110 aa11.95□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 OR4D11Q8NGI4 311 aa11.95□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 MAGT1Q9H0U3 335 aa11.95□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 TXNIPQ9H3M7 391 aa11.95□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 PLPP3O14495 311 aa11.95□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 UBE2G1P62253 170 aa11.95□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 RHOBP62745 196 aa11.95□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 PLP2Q04941 152 aa11.95□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 TM4SF18Q96CE8 201 aa11.95□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 FAM24AA6NFZ4 105 aa11.95□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 ATP5LO75964 103 aa11.95□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 ZNF728P0DKX0 622 aa11.95□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 RPS18P62269 152 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 C2orf68Q2NKX9 166 aa11.95□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 OR2M3Q8NG83 312 aa11.95□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 ADTRPQ96IZ2 230 aa11.95□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 RAB40CQ96S21 281 aa11.95□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 DOCK8Q8NF50 2099 aa11.95□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa11.95□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 CD300LBA8K4G0 201 aa11.95□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 PPP1R3DO95685 299 aa11.95□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 GYPAP02724 150 aa11.95□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 CRYGCP07315 174 aa11.95□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 ZADH2Q8N4Q0 377 aa11.95□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa11.95□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 HYPMO75409 117 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 AREGP15514 252 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 NMUP48645 174 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 ATP23Q9Y6H3 246 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 RLFQ13129 1914 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 PDLIM4P50479 330 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 CEACAM16Q2WEN9 425 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 TIMM23BQ5SRD1 257 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 ABHD17CQ6PCB6 329 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 CD8AP01732 235 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 CSRP3P50461 194 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 C17orf47Q8NEP4 570 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 RNF183Q96D59 192 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 RAX2Q96IS3 184 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 NAA60Q9H7X0 242 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 CES1P1Q9UKY3 287 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 F5H768 121 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 G3V4G9 280 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 J3QR06 171 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 BTCP35070 178 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 NR2C2APQ86WQ0 139 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 C10orf111Q8N326 155 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 GLIPR2Q9H4G4 154 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 SCN5AQ14524 2016 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 FAM231BA6NCW3 169 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 ZNF85Q03923 595 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 GAGE13Q4V321 117 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 A1L4Q6 167 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-202ENST00000382998 SSR4P51571 173 aa11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.3 ms