RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 PROP1O75360 226 aa12.66□□□□□ -0.38
CASQ1-201ENST00000368078 FGL1Q08830 312 aa12.66□□□□□ -0.38
CASQ1-201ENST00000368078 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF585BQ52M93 769 aa12.66□□□□□ -0.38
CASQ1-201ENST00000368078 LRRC10Q5BKY1 277 aa12.66□□□□□ -0.38
CASQ1-201ENST00000368078 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa12.66□□□□□ -0.38
CASQ1-201ENST00000368078 OR52M1Q8NGK5 317 aa12.66□□□□□ -0.38
CASQ1-201ENST00000368078 GFOD1Q9NXC2 390 aa12.66□□□□□ -0.38
CASQ1-201ENST00000368078 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa12.66□□□□□ -0.38
CASQ1-201ENST00000368078 MBD2Q9UBB5 411 aa12.66□□□□□ -0.38
CASQ1-201ENST00000368078 JPT1Q9UK76 154 aa12.66□□□□□ -0.38
CASQ1-201ENST00000368078 hADV38S2A0JD32 116 aa12.65□□□□□ -0.38
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
CASQ1-201ENST00000368078 L7N2F9 121 aa12.65□□□□□ -0.38
CASQ1-201ENST00000368078 IGKV1-39P01597 117 aa12.65□□□□□ -0.38
CASQ1-201ENST00000368078 IGKV1D-39P04432 117 aa12.65□□□□□ -0.38
CASQ1-201ENST00000368078 SLC25A4P12235 298 aa12.65□□□□□ -0.38
CASQ1-201ENST00000368078 S100GP29377 79 aa12.65□□□□□ -0.38
CASQ1-201ENST00000368078 TMUB2Q71RG4 321 aa12.65□□□□□ -0.38
CASQ1-201ENST00000368078 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa12.65□□□□□ -0.38
CASQ1-201ENST00000368078 OR5AC2Q9NZP5 309 aa12.65□□□□□ -0.38
CASQ1-201ENST00000368078 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa12.65□□□□□ -0.38
CASQ1-201ENST00000368078 NDUFA2O43678 99 aa12.65□□□□□ -0.38
CASQ1-201ENST00000368078 BRWD1-AS2P59051 145 aa12.65□□□□□ -0.38
CASQ1-201ENST00000368078 CT45A1Q5HYN5 189 aa12.65□□□□□ -0.38
CASQ1-201ENST00000368078 OR2B11Q5JQS5 317 aa12.65□□□□□ -0.38
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF841Q6ZN19 808 aa12.65□□□□□ -0.38
CASQ1-201ENST00000368078 CT45A3Q8NHU0 189 aa12.65□□□□□ -0.38
CASQ1-201ENST00000368078 THAP6Q8TBB0 222 aa12.65□□□□□ -0.38
CASQ1-201ENST00000368078 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
CASQ1-201ENST00000368078 MFFQ9GZY8 342 aa12.65□□□□□ -0.38
CASQ1-201ENST00000368078 LINC00312Q9Y6C7 94 aa12.65□□□□□ -0.38
CASQ1-201ENST00000368078 A0A0G2JRQ6 117 aa12.64□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 PPIHO43447 177 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 RAMP3O60896 148 aa12.64□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 SCGB1D2O95969 90 aa12.64□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 S100A10P60903 97 aa12.64□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 OPCMLQ14982 345 aa12.64□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa12.64□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 Q3ZCU0 254 aa12.64□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 RPL39P5Q59GN2 51 aa12.64□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM65Q6PI78 240 aa12.64□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 LINC00574Q9H8X3 128 aa12.64□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 ZNRD1Q9P1U0 126 aa12.64□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 TNFSF18Q9UNG2 199 aa12.64□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 LINC00473A8K010 186 aa12.63□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 SERPINE2P07093 398 aa12.63□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 GNG10P50151 68 aa12.63□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 OR1S1Q8NH92 325 aa12.63□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 EDARADDQ8WWZ3 215 aa12.63□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 SLA2Q9H6Q3 261 aa12.63□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 TMED3Q9Y3Q3 217 aa12.63□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 C17orf98A8MV24 154 aa12.63□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 MBPP02686 304 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 RPA2P15927 270 aa12.63□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 GPR12P47775 334 aa12.63□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 SRPXP78539 464 aa12.63□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 ZBTB34Q8NCN2 500 aa12.63□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 DCUN1D4Q92564 292 aa12.63□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF714Q96N38 554 aa12.63□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 GON7Q9BXV9 100 aa12.63□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 ARL6Q9H0F7 186 aa12.63□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 IFI27L2Q9H2X8 130 aa12.63□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 NARFLQ9H6Q4 476 aa12.63□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa12.63□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 TAS2R3Q9NYW6 316 aa12.63□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 RNF222A6NCQ9 220 aa12.62□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 CLDN1O95832 211 aa12.62□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 WNT2P09544 360 aa12.62□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 S100A11P31949 105 aa12.62□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 LPAR6P43657 344 aa12.62□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 Q6ZRM9 215 aa12.62□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF439Q8NDP4 499 aa12.62□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 GPR146Q96CH1 333 aa12.62□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 RGS13O14921 159 aa12.61□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 NXPH3O95157 252 aa12.61□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 CFDP00746 253 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 F12P00748 615 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 NMSQ5H8A3 153 aa12.61□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 NCR3LG1Q68D85 454 aa12.61□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 PRSS54Q6PEW0 395 aa12.61□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 ODF3L1Q8IXM7 274 aa12.61□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 OR8H1Q8NGG4 311 aa12.61□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa12.61□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa12.61□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 IGKV1-5P01602 117 aa12.61□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 EPHA1P21709 976 aa12.61□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 VDAC1P21796 283 aa12.61□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 DLX1P56177 255 aa12.61□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 DLX6P56179 175 aa12.61□□□□□ -0.39
CASQ1-201ENST00000368078 OR4D5Q8NGN0 318 aa12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.8 ms