RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 PRO3102Q9H379 93 aa14.3□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 RBM11P57052 281 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 MMDQ15546 238 aa14.29□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 PHYHD1Q5SRE7 291 aa14.29□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 OR10V1Q8NGI7 309 aa14.29□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 OR51H1Q8NH63 302 aa14.29□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa14.29□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 LINC00310P59036 64 aa14.29□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 HBG1P69891 147 aa14.29□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 HBG2P69892 147 aa14.29□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa14.29□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa14.29□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 OR1K1Q8NGR3 316 aa14.29□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP14.29□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 EXTL1Q92935 676 aa14.29□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa14.29□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 CCL25O15444 150 aa14.28□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 SYNGR2O43760 224 aa14.28□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 VENTXO95231 258 aa14.28□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 CCL3P10147 92 aa14.28□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 SSPNQ14714 243 aa14.28□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 CACNG5Q9UF02 275 aa14.28□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa14.28□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 DKK1O94907 266 aa14.28□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 TDGF1P13385 188 aa14.28□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 SOX8P57073 446 aa14.28□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 SPTSSAQ969W0 71 aa14.28□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 PAGE4O60829 102 aa14.28□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 NDUFB8O95169 186 aa14.28□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 PTTG1IPP53801 180 aa14.28□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 RAET1LQ5VY80 246 aa14.28□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 LEMD1Q68G75 181 aa14.28□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 ACSM6Q6P461 480 aa14.28□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 STPG4Q8N801 248 aa14.28□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 NRASP01111 189 aa14.27□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 SERPINE2P07093 398 aa14.27□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 F2RP25116 425 aa14.27□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 SELENOTP62341 195 aa14.27□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 PAFAH1B2P68402 229 aa14.27□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 NABP1Q96AH0 204 aa14.27□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.12
GDE1-201ENST00000353258 DOCK11Q5JSL3 2073 aa14.27□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 SERF1AO75920 110 aa14.27□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 PSG2P11465 335 aa14.27□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 EGR1P18146 543 aa14.27□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 NPPCP23582 126 aa14.27□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 SPANXN5Q5MJ07 72 aa14.27□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 LINC01551Q86U37 167 aa14.27□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 UCN2Q96RP3 112 aa14.27□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa14.27□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 ITGB1BP1O14713 200 aa14.26□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 COMPP49747 757 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 FADS6Q8N9I5 356 aa14.26□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 AGBL5Q8NDL9 886 aa14.26□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 MLNRO43193 412 aa14.26□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 TUSC2O75896 110 aa14.26□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 WNT2P09544 360 aa14.26□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 ETFRF1Q6IPR1 90 aa14.26□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 SGMS2Q8NHU3 365 aa14.26□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 ELOVL5Q9NYP7 299 aa14.26□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa14.25□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa14.25□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 AQP7P3A6NL99 342 aa14.25□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 OR5G3P0C626 314 aa14.25□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 C1QTNF9P0C862 333 aa14.25□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 LPAL2Q16609 132 aa14.25□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 ZNF709Q8N972 641 aa14.25□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 IL36GQ9NZH8 169 aa14.25□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa14.25□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 TMEM265A0A087WTH1 108 aa14.25□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa14.25□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 AQP7O14520 342 aa14.25□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 HSPB6O14558 160 aa14.25□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 HS3ST1O14792 307 aa14.25□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 MPLP40238 635 aa14.25□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 SLC38A11Q08AI6 406 aa14.25□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 OR8G2PQ6IF36 304 aa14.25□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 OR5AU1Q8NGC0 362 aa14.25□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 TECTBQ96PL2 329 aa14.25□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 COX6A1P12074 109 aa14.25□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 WIPI2Q9Y4P8 454 aa14.25□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 PGPEP1LA6NFU8 196 aa14.24□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 CD300LBA8K4G0 201 aa14.24□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 SLC25A6P12236 298 aa14.24□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 DEFA4P12838 97 aa14.24□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 PMP22Q01453 160 aa14.24□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 MSMO1Q15800 293 aa14.24□□□□□ -0.13
GDE1-201ENST00000353258 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms