RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 CT45A7P0DMV0 189 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 MDKP21741 143 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 DCTDP32321 178 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 RPS19P39019 145 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 OPRK1P41145 380 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 IL24Q13007 206 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 IL13RA2Q14627 380 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 UBE2V2Q15819 145 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 SWI5Q1ZZU3 235 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 CT45A1Q5HYN5 189 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 HCP5Q6MZN7 132 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 OR8H3Q8N146 312 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 BVESQ8NE79 360 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 LFNGQ8NES3 379 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 CT45A3Q8NHU0 189 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 NABP1Q96AH0 204 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 LINC00052Q96N35 136 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 MGAT4CQ9UBM8 478 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 VPREB3Q9UKI3 123 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1W2PP11 408 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 PSKH1P11801 424 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 DTYMKP23919 212 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 ROM1Q03395 351 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF273Q14593 569 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 PYHIN1Q6K0P9 492 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 PRSS35Q8N3Z0 413 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 SNAPC3Q92966 411 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 SELENOKQ9Y6D0 94 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 S4R3C0 116 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 C22orf46C9J442 243 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 NAT1P18440 290 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 ZP3P21754 424 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 ZP1P60852 638 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 TREML4Q6UXN2 200 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 BEND2Q8NDZ0 799 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 OR10R2Q8NGX6 335 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 TAS2R3Q9NYW6 316 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 RPH3ALQ9UNE2 315 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 DOCK11Q5JSL3 2073 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1W2PPR1 153 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 SIAH2O43255 324 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 OR2J3O76001 311 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 PAX1P15863 534 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 PI3P19957 117 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 THBS3P49746 956 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 EMP1P54849 157 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 RBM11P57052 281 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 UBA52P62987 128 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
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PTPRC-201ENST00000348564 RHOUQ7L0Q8 258 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 MMD2Q8IY49 270 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF485Q8NCK3 441 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 STXBP6Q8NFX7 210 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 DCUN1D4Q92564 292 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 PEMTQ9UBM1 199 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 M0QYG6 137 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 TXNL1O43396 289 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 PFDN1O60925 122 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 PRH1P02810 166 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 ISG15P05161 165 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 IGHV1-8P0DP01 117 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 ERP29P30040 261 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 KIR3DL2P43630 455 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 LPAR6P43657 344 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 TFF3Q07654 80 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 OR2F1Q13607 317 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 ANKRD55Q3KP44 614 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM91Q6ZNR0 172 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 IDO2Q6ZQW0 420 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 Q6ZR03 302 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 RNF144BQ7Z419 303 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 GBGT1Q8N5D6 347 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 OR52B4Q8NGK2 314 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 OR13A1Q8NGR1 328 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 PGLYRP3Q96LB9 341 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 ASCL2Q99929 193 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 ARPC5LQ9BPX5 153 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 UQCC2Q9BRT2 126 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 OR51I2Q9H344 312 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 CLEC5AQ9NY25 188 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 MTCH1Q9NZJ7 389 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF222Q9UK12 451 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 FOXJ3Q9UPW0 622 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 SLC17A2O00624 439 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 PGA5P0DJD9 388 aa3.66□□□□□ -1.82
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