RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 OR52M1Q8NGK5 317 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 GRPEL2Q8TAA5 225 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 RAB1CQ92928 201 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 IL22RA2Q969J5 263 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 RAB39BQ96DA2 213 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 C18orf12Q96KH6 178 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 TP53RKQ96S44 253 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 TAS2R3Q9NYW6 316 aa8.38□□□□□ -1.07
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RABGGTB-201ENST00000319942 LAMP3Q9UQV4 416 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
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RABGGTB-201ENST00000319942 A6NNC1 897 aa8.37□□□□□ -1.07
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RABGGTB-201ENST00000319942 ARPC5O15511 151 aa8.37□□□□□ -1.07
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RABGGTB-201ENST00000319942 RAB7AP51149 207 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 CATR1Q13166 79 aa8.37□□□□□ -1.07
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RABGGTB-201ENST00000319942 OR10C1Q96KK4 312 aa8.37□□□□□ -1.07
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RABGGTB-201ENST00000319942 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa8.37□□□□□ -1.07
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RABGGTB-201ENST00000319942 PLSCR3Q9NRY6 295 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 C19orf84I3L1E1 186 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 DVL1O14640 695 aa8.36□□□□□ -1.07
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RABGGTB-201ENST00000319942 PRB1P04280 392 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 IGHV3-43DP0DP04 118 aa8.36□□□□□ -1.07
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RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 GPR12P47775 334 aa8.36□□□□□ -1.07
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RABGGTB-201ENST00000319942 C11orf71Q6IPW1 123 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa8.36□□□□□ -1.07
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RABGGTB-201ENST00000319942 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
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RABGGTB-201ENST00000319942 OR2F2O95006 317 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 IGLV2-14P01704 120 aa8.35□□□□□ -1.07
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RABGGTB-201ENST00000319942 DUX4L5P0CJ88 424 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 DUX4L6P0CJ89 424 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 DUX4L7P0CJ90 424 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 LYNX1P0DP58 116 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 S100A11P31949 105 aa8.35□□□□□ -1.07
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RABGGTB-201ENST00000319942 OPCMLQ14982 345 aa8.35□□□□□ -1.07
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RABGGTB-201ENST00000319942 MISP3Q96FF7 219 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF714Q96N38 554 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 UBTD1Q9HAC8 227 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 GFOD1Q9NXC2 390 aa8.35□□□□□ -1.07
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