RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000280780.6

FAM53B-201, Transcript of family with sequence similarity 53 member B, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM53B, Length 1,568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM53B-201	ENST00000280780	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		18.22	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	ZNF626	Q68DY1	528 aa		18.22	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		18.22	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		18.22	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		18.22	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		18.22	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	TNFRSF14	Q92956	283 aa		18.22	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		18.22	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	JPT1	Q9UK76	154 aa		18.22	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		18.22	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	OR5H14	A6NHG9	310 aa		18.21	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	ZBTB25	P24278	435 aa		18.21	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	HCP5	Q6MZN7	132 aa		18.21	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		18.21	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		18.21	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		18.21	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	BEX1	Q9HBH7	125 aa		18.21	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	GNG12	Q9UBI6	72 aa		18.21	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780		A0A087X0M5	115 aa		18.21	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780		A0A1B0GX30	115 aa		18.21	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	TUSC2	O75896	110 aa		18.21	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	PRTN3	P24158	256 aa		18.21	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	CEACAM6	P40199	344 aa		18.21	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	MORN2	Q502X0	79 aa		18.21	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		18.21	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		18.21	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		18.21	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	RAB9B	Q9NP90	201 aa		18.21	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	RDH8	Q9NYR8	311 aa		18.21	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	SLC31A2	O15432	143 aa		18.2	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	HSPA12A	O43301	675 aa		18.2	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	TOX4	O94842	621 aa		18.2	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	OR4E1	P0C645	316 aa		18.2	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	HNF1A	P20823	631 aa		18.2	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	FCGR2C	P31995	323 aa		18.2	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	ZNF134	P52741	427 aa		18.2	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	UCP3	P55916	312 aa		18.2	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	TAS2R31	P59538	309 aa		18.2	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	CBX3	Q13185	183 aa		18.2	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	KLRD1	Q13241	179 aa		18.2	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		18.2	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	MOB3A	Q96BX8	217 aa		18.2	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		18.2	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		18.2	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	MED28	Q9H204	178 aa		18.2	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		18.2	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		18.2	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		18.2	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		18.2	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	18.19	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	YPEL1	O60688	119 aa		18.19	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	CCNK	O75909	580 aa		18.19	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		18.19	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		18.19	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	AADAC	P22760	399 aa		18.19	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	DHODH	Q02127	395 aa		18.19	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	CD300C	Q08708	224 aa		18.19	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		18.19	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		18.19	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	YPEL2	Q96QA6	119 aa		18.19	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	ZNF69	Q9UC07	566 aa		18.19	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	PSG11	Q9UQ72	335 aa		18.19	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		18.18	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780		A0A1W2PPE2	198 aa		18.18	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780		A0A1W2PPE3	182 aa		18.18	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780		A0A1W2PR64	198 aa		18.18	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780		A0A1W2PRV1	198 aa		18.18	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		18.18	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		18.17	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		18.17	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		18.17	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	FAM157C	P0CG43	387 aa		18.17	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		18.17	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	GATA3	P23771	443 aa		18.17	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	COX7A1	P24310	79 aa		18.17	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	CD34	P28906	385 aa		18.17	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	GNG10	P50151	68 aa		18.17	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	FCN2	Q15485	313 aa		18.17	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	PPY	P01298	95 aa		18.17	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	DHRS2	Q13268	280 aa		18.17	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	C4orf46	Q504U0	113 aa		18.17	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		18.17	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		18.17	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	PNKD	Q8N490	385 aa		18.17	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		18.17	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	TMEM230	Q96A57	120 aa		18.17	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		18.17	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	AUP1	Q9Y679	476 aa		18.17	■□□□□ 0.5
FAM53B-201	ENST00000280780	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	18.16	■□□□□ 0.5

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