RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000605847.5

NEDD8-MDP1-204, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 5

Gene NEDD8-MDP1, Length 758 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TMED1Q13445 227 aa11.64□□□□□ -0.55
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SLC22A6Q4U2R8 563 aa11.59□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 C6orf141Q5SZD1 244 aa11.59□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SLC16A13Q7RTY0 426 aa11.59□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GGTLC1Q9BX51 225 aa11.59□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TAS2R4Q9NYW5 299 aa11.59□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PIPOXQ9P0Z9 390 aa11.59□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa11.59□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KIAA1109Q2LD37 5005 aa11.58□□□□□ -0.56
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 YPEL1O60688 119 aa11.58□□□□□ -0.56
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MAS1P04201 325 aa11.58□□□□□ -0.56
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LGALS7P47929 136 aa11.58□□□□□ -0.56
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SOX2P48431 317 aa11.58□□□□□ -0.56
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