RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 IGLV1-51P01701 117 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 MT-ND2P03891 347 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 OR2T7P0C7T2 308 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF735P0CB33 412 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 GZMHP20718 246 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 CNTFRP26992 372 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 FAM220AQ7Z4H9 259 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 TCEANCQ8N8B7 351 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 C8orf31Q8N9H6 132 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 OR13C9Q8NGT0 318 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 ARL11Q969Q4 196 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 RETNQ9HD89 108 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 BATF3Q9NR55 127 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 TPSG1Q9NRR2 321 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 ARL8BQ9NVJ2 186 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 KIAA1456Q9P272 454 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 GNG8Q9UK08 70 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 ERGIC3Q9Y282 383 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 MYRFQ9Y2G1 1151 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 A0A1W2PN81 502 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 SMIM30A4D0T7 59 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 M0R129 80 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 FAM107AO95990 144 aa6.99□□□□□ -1.29
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PTPRM-210ENST00000578916 IGHV3-43DP0DP04 118 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 CALB2P22676 271 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 CHRNA7P36544 502 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 CDKN1BP46527 198 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 MS4A2Q01362 244 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 PAX5Q02548 391 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 DYRK1AQ13627 763 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 IL13RA2Q14627 380 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 ECSCRQ19T08 205 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 FAHD1Q6P587 224 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 GTSCR1Q86UQ5 136 aa6.99□□□□□ -1.29
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PTPRM-210ENST00000578916 ZNF680Q8NEM1 530 aa6.99□□□□□ -1.29
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PTPRM-210ENST00000578916 UBALD1Q8TB05 177 aa6.99□□□□□ -1.29
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PTPRM-210ENST00000578916 CASTOR1Q8WTX7 329 aa6.99□□□□□ -1.29
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PTPRM-210ENST00000578916 C12orf4Q9NQ89 552 aa6.99□□□□□ -1.29
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PTPRM-210ENST00000578916 SLC31A2O15432 143 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 IGHV3-11P01762 117 aa6.98□□□□□ -1.29
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PTPRM-210ENST00000578916 ACTBP60709 375 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 LSAMPQ13449 338 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 GAMTQ14353 236 aa6.98□□□□□ -1.29
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PTPRM-210ENST00000578916 TP53I3Q53FA7 332 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 CT83Q5H943 113 aa6.98□□□□□ -1.29
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PTPRM-210ENST00000578916 ELP2Q6IA86 826 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
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PTPRM-210ENST00000578916 OR2G2Q8NGZ5 317 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 OR10AC1Q8NH08 325 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 CCDC107Q8WV48 283 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 DNAJC9Q8WXX5 260 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 SLC29A1Q99808 456 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF251Q9BRH9 671 aa6.98□□□□□ -1.29
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PTPRM-210ENST00000578916 HIPK2Q9H2X6 1198 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM140Q9NV12 185 aa6.98□□□□□ -1.29
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PTPRM-210ENST00000578916 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 C15orf65H3BRN8 121 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 NBR2O15453 112 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 ORC5O43913 435 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 SOX15O60248 233 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 APOA1P02647 267 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 VHLP40337 213 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF137PP52743 207 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 EFNB1P98172 346 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 RAB40BQ12829 278 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-210ENST00000578916 RSU1Q15404 277 aa6.97□□□□□ -1.29
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