RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575194.5

SPNS3-204, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SPNS3, Length 1,721 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-204ENST00000575194 SPINT2O43291 252 aa15.66■□□□□ 0.1
SPNS3-204ENST00000575194 SPRY3O43610 288 aa15.66■□□□□ 0.1
SPNS3-204ENST00000575194 EGR1P18146 543 aa15.66■□□□□ 0.1
SPNS3-204ENST00000575194 DMBX1Q8NFW5 382 aa15.66■□□□□ 0.1
SPNS3-204ENST00000575194 ITLN1Q8WWA0 313 aa15.66■□□□□ 0.1
SPNS3-204ENST00000575194 ERGIC1Q969X5 290 aa15.66■□□□□ 0.1
SPNS3-204ENST00000575194 SNX22Q96L94 193 aa15.66■□□□□ 0.1
SPNS3-204ENST00000575194 GPHA2Q96T91 129 aa15.66■□□□□ 0.1
SPNS3-204ENST00000575194 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
SPNS3-204ENST00000575194 SLC25A31Q9H0C2 315 aa15.66■□□□□ 0.1
SPNS3-204ENST00000575194 TAS2R3Q9NYW6 316 aa15.66■□□□□ 0.1
SPNS3-204ENST00000575194 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa15.66■□□□□ 0.1
SPNS3-204ENST00000575194 MGST3O14880 152 aa15.65■□□□□ 0.1
SPNS3-204ENST00000575194 IGLV2-14P01704 120 aa15.65■□□□□ 0.1
SPNS3-204ENST00000575194 DRAM1Q8N682 238 aa15.65■□□□□ 0.1
SPNS3-204ENST00000575194 UBALD1Q8TB05 177 aa15.65■□□□□ 0.1
SPNS3-204ENST00000575194 MRGPRDQ8TDS7 321 aa15.65■□□□□ 0.1
SPNS3-204ENST00000575194 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
SPNS3-204ENST00000575194 IL19Q9UHD0 177 aa15.65■□□□□ 0.1
SPNS3-204ENST00000575194 NUP50Q9UKX7 468 aa15.65■□□□□ 0.1
SPNS3-204ENST00000575194 RAB19A4D1S5 217 aa15.65■□□□□ 0.1
SPNS3-204ENST00000575194 WRBO00258 174 aa15.65■□□□□ 0.1
SPNS3-204ENST00000575194 CCL21O00585 134 aa15.65■□□□□ 0.1
SPNS3-204ENST00000575194 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
SPNS3-204ENST00000575194 UQCC3Q6UW78 93 aa15.65■□□□□ 0.1
SPNS3-204ENST00000575194 OR2C3Q8N628 320 aa15.65■□□□□ 0.1
SPNS3-204ENST00000575194 GCSAMQ8N6F7 178 aa15.65■□□□□ 0.1
SPNS3-204ENST00000575194 RND1Q92730 232 aa15.65■□□□□ 0.1
SPNS3-204ENST00000575194 ARL11Q969Q4 196 aa15.65■□□□□ 0.1
SPNS3-204ENST00000575194 C11orf1Q9H5F2 150 aa15.65■□□□□ 0.1
SPNS3-204ENST00000575194 LPAR3Q9UBY5 353 aa15.65■□□□□ 0.1
SPNS3-204ENST00000575194 METRNQ9UJH8 293 aa15.65■□□□□ 0.1
SPNS3-204ENST00000575194 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa15.64■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 ZNF737O75373 536 aa15.64■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 LHBP01229 141 aa15.64■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 ADH4P08319 380 aa15.64■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 GNLYP22749 145 aa15.64■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 UQCRFS1P47985 274 aa15.64■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 GLIPR1P48060 266 aa15.64■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 HTD2P86397 168 aa15.64■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 WFDC8Q8IUA0 241 aa15.64■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 DIRC2Q96SL1 478 aa15.64■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 SMIM3Q9BZL3 60 aa15.64■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 RAB9BQ9NP90 201 aa15.64■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 RNF7Q9UBF6 113 aa15.64■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 TEX46H3BTG2 121 aa15.63■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 SSSCA1O60232 199 aa15.63■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP15.63■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 ID3Q02535 119 aa15.63■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 CATR1Q13166 79 aa15.63■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa15.63■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 OR13A1Q8NGR1 328 aa15.63■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 MARC2Q969Z3 335 aa15.63■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 OR2D2Q9H210 308 aa15.63■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 ARV1Q9H2C2 271 aa15.63■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 NGBQ9NPG2 151 aa15.63■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 ATG12O94817 140 aa15.63■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 IGHV1-46P01743 117 aa15.63■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 GZMHP20718 246 aa15.63■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP15.63■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 EDDM3AQ14507 147 aa15.63■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 OR52L2PQ8NGH6 319 aa15.63■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 OR1S2Q8NGQ3 325 aa15.63■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 LINC00052Q96N35 136 aa15.63■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa15.63■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa15.62■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 ODAMA1E959 279 aa15.62■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 VSTM5A8MXK1 200 aa15.62■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 TFF1P04155 84 aa15.62■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 FAM157CP0CG43 387 aa15.62■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 SULT1A2P50226 295 aa15.62■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 AKR1C2P52895 323 aa15.62■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 BLOC1S1P78537 153 aa15.62■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 BAXQ07812 192 aa15.62■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 Q8TCH9 128 aa15.62■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 FAM222BQ8WU58 562 aa15.62■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 EDARADDQ8WWZ3 215 aa15.62■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 GPR146Q96CH1 333 aa15.62■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 ABCD4O14678 606 aa15.61■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 PITX3O75364 302 aa15.61■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 CRYZL1O95825 349 aa15.61■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 IRF2P14316 349 aa15.61■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 EPHA1P21709 976 aa15.61■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 CAV2P51636 162 aa15.61■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 ZNF266Q14584 549 aa15.61■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 IL34Q6ZMJ4 242 aa15.61■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 C22orf34Q6ZV56 151 aa15.61■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 STPG2Q8N412 459 aa15.61■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 ZNF561Q8N587 486 aa15.61■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 SMIM8Q96KF7 97 aa15.61■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 GINS3Q9BRX5 216 aa15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms