RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 OR10Z1Q8NGY1 313 aa7.47□□□□□ -1.21
SMAD3-215ENST00000560424 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
SMAD3-215ENST00000560424 RASL12Q9NYN1 266 aa7.47□□□□□ -1.21
SMAD3-215ENST00000560424 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
SMAD3-215ENST00000560424 KLK11Q9UBX7 282 aa7.47□□□□□ -1.21
SMAD3-215ENST00000560424 TCF19Q9Y242 345 aa7.47□□□□□ -1.21
SMAD3-215ENST00000560424 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa7.46□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 FUOMA2VDF0 154 aa7.46□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM235A6NFC5 223 aa7.46□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 RAMP3O60896 148 aa7.46□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP7.46□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 GNB3P16520 340 aa7.46□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 BCL3P20749 454 aa7.46□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 FUT3P21217 361 aa7.46□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 DTYMKP23919 212 aa7.46□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 BTCP35070 178 aa7.46□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 NPBWR2P48146 333 aa7.46□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 TAS2R19P59542 299 aa7.46□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 GMFBP60983 142 aa7.46□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 MADCAM1Q13477 382 aa7.46□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM95Q3KNT9 176 aa7.46□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 NRARPQ7Z6K4 114 aa7.46□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 FAM185AQ8N0U4 392 aa7.46□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 FAM58AQ8N1B3 248 aa7.46□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 SLAMF9Q96A28 289 aa7.46□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 MED30Q96HR3 178 aa7.46□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa7.46□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 NEDD4LQ96PU5 975 aa7.46□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 PECRQ9BY49 303 aa7.46□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 CHST6Q9GZX3 395 aa7.46□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa7.46□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 A0A1W2PPE2 198 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 A0A1W2PPH5 198 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 A0A1W2PR64 198 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 A0A1W2PRV1 198 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 SSX5O60225 188 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 RHBDL1O75783 438 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 LHBP01229 141 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 AKAIN1P0CW23 69 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 PTHLHP12272 177 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 GNG2P59768 71 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 PAX5Q02548 391 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 ACTBL2Q562R1 376 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 WDR82Q6UXN9 313 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 Q6ZS49 121 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 HOGA1Q86XE5 327 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 LINC00482Q8N8I6 264 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 CHST4Q8NCG5 386 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 OR5T2Q8NGG2 359 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 ENKURQ8TC29 256 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 CAPSLQ8WWF8 208 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 CREB3L1Q96BA8 519 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 MARVELD1Q9BSK0 173 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 HRASLSQ9HDD0 168 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 SLC2A8Q9NY64 477 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 SACSQ9NZJ4 4579 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa7.44□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 F8VVB4 439 aa7.44□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 F8VWA3 439 aa7.44□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 CDIPTO14735 213 aa7.44□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 SELLP14151 372 aa7.44□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 GABRR1P24046 479 aa7.44□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 COX7A1P24310 79 aa7.44□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 RAB13P51153 203 aa7.44□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 MECP2P51608 486 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 MEF2DQ14814 521 aa7.44□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 PIGYQ3MUY2 71 aa7.44□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 NKAPLQ5M9Q1 402 aa7.44□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 ZFAND6Q6FIF0 208 aa7.44□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 STEAP1BQ6NZ63 245 aa7.44□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 PLET1Q6UQ28 207 aa7.44□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa7.44□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 GAPTQ8N292 157 aa7.44□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 CHAC2Q8WUX2 184 aa7.44□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 RCHY1Q96PM5 261 aa7.44□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 DNTTIP1Q9H147 329 aa7.44□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 C12orf4Q9NQ89 552 aa7.44□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa7.44□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 A6NDX4 124 aa7.43□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 NAPSAO96009 420 aa7.43□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 PRKACAP17612 351 aa7.43□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 KCNJ3P48549 501 aa7.43□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 BLCAPP62952 87 aa7.43□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 ARFRP1Q13795 201 aa7.43□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 SMIM21Q3B7S5 101 aa7.43□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 STUMQ69YW2 141 aa7.43□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 HCP5Q6MZN7 132 aa7.43□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 Q6P435 159 aa7.43□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 C6orf201Q7Z4U5 140 aa7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms