RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ORC5O43913 435 aa7.49□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EDF1O60869 148 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HMGN1P05114 100 aa7.49□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRT8P05787 483 aa7.49□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DBTP11182 482 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COX4I1P13073 169 aa7.49□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KCNJ3P48549 501 aa7.49□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PSME3P61289 254 aa7.49□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GNMTQ14749 295 aa7.49□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LGALS9BQ3B8N2 356 aa7.49□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANKRD55Q3KP44 614 aa7.49□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SOHLH1Q5JUK2 328 aa7.49□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LPCAT4Q643R3 524 aa7.49□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UTS2BQ765I0 119 aa7.49□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C5orf24Q7Z6I8 188 aa7.49□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ODF3L1Q8IXM7 274 aa7.49□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SAXO1Q8IYX7 474 aa7.49□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR10G2Q8NGC3 310 aa7.49□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR52L2PQ8NGH6 319 aa7.49□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 THRSPQ92748 146 aa7.49□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C10orf35Q96D05 121 aa7.49□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NSMCE2Q96MF7 247 aa7.49□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR2S2Q9NQN1 319 aa7.49□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MLXQ9UH92 298 aa7.49□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HTR3BO95264 441 aa7.48□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HBZP02008 142 aa7.48□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CBLN1P23435 193 aa7.48□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LGALS7P47929 136 aa7.48□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PAX5Q02548 391 aa7.48□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 Q3ZCU0 254 aa7.48□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ATAD3CQ5T2N8 411 aa7.48□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR1L6Q8NGR2 347 aa7.48□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR11H2Q8NH07 326 aa7.48□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR4K15Q8NH41 348 aa7.48□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 USMG5Q96IX5 58 aa7.48□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FEVQ99581 238 aa7.48□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SIKE1Q9BRV8 207 aa7.48□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa7.48□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EFCAB1Q9HAE3 211 aa7.48□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MRGBPQ9NV56 204 aa7.48□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TVP23BQ9NYZ1 205 aa7.48□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ABCD2Q9UBJ2 740 aa7.48□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa7.48□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HMCN2Q8NDA2 5059 aa7.47□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa7.47□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF320A2RRD8 509 aa7.47□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C11orf94C9JXX5 98 aa7.47□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR2C1O95371 312 aa7.47□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FADS2O95864 444 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRH1P02810 166 aa7.47□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MT-ND4P03905 459 aa7.47□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 P0DMU3 169 aa7.47□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM231AP0DMU4 169 aa7.47□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM231CP0DMU5 169 aa7.47□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TNP2Q05952 138 aa7.47□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RIPK1Q13546 671 aa7.47□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IL13RA2Q14627 380 aa7.47□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PSG5Q15238 335 aa7.47□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KISS1Q15726 138 aa7.47□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MORN2Q502X0 79 aa7.47□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PVRIGQ6DKI7 326 aa7.47□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BTNL8Q6UX41 500 aa7.47□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa7.47□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC54Q8NEL0 328 aa7.47□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR5B3Q8NH48 314 aa7.47□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KCNG3Q8TAE7 436 aa7.47□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM192AQ9GZU8 254 aa7.47□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 REEP1Q9H902 201 aa7.47□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa7.46□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa7.46□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARPC2O15144 300 aa7.46□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC22A1O15245 554 aa7.46□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LINC00205P59089 165 aa7.46□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDK5Q00535 292 aa7.46□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PJVKQ0ZLH3 352 aa7.46□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RSU1Q15404 277 aa7.46□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa7.46□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPATS1Q496A3 300 aa7.46□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C1orf134Q5TEV5 83 aa7.46□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STEAP3Q658P3 488 aa7.46□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ELP2Q6IA86 826 aa7.46□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CD300LDQ6UXZ3 194 aa7.46□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LINC00596Q86U02 117 aa7.46□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NR2C2APQ86WQ0 139 aa7.46□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIR2DL5AQ8N109 375 aa7.46□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UXS1Q8NBZ7 420 aa7.46□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR51A4Q8NGJ6 313 aa7.46□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR13C3Q8NGS6 347 aa7.46□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR4A5Q8NH83 315 aa7.46□□□□□ -1.22
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms