RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 DNAH1Q9P2D7 4330 aa2.41□□□□□ -2.02
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CLVS1-209ENST00000522928 A6NDX4 124 aa2.41□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 A6NIZ1 184 aa2.41□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 CENPBD1B2RD01 187 aa2.41□□□□□ -2.02
CLVS1-209ENST00000522928 H0Y8G0 127 aa2.41□□□□□ -2.02
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CLVS1-209ENST00000522928 LINC00471Q8N535 108 aa2.4□□□□□ -2.03
CLVS1-209ENST00000522928 MNS1Q8NEH6 495 aa2.4□□□□□ -2.03
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