RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519651.5

TSNARE1-204, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSNARE1, Length 2,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-204ENST00000519651 FAM222BQ8WU58 562 aa14.6□□□□□ -0.07
TSNARE1-204ENST00000519651 DIRC2Q96SL1 478 aa14.6□□□□□ -0.07
TSNARE1-204ENST00000519651 TOLLIPQ9H0E2 274 aa14.6□□□□□ -0.07
TSNARE1-204ENST00000519651 MED9Q9NWA0 146 aa14.6□□□□□ -0.07
TSNARE1-204ENST00000519651 SDHAF2Q9NX18 166 aa14.6□□□□□ -0.07
TSNARE1-204ENST00000519651 FBXL17Q9UF56 701 aa14.6□□□□□ -0.07
TSNARE1-204ENST00000519651 EPHA1P21709 976 aa14.6□□□□□ -0.07
TSNARE1-204ENST00000519651 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TSNARE1-204ENST00000519651 ZNF561Q8N587 486 aa14.6□□□□□ -0.07
TSNARE1-204ENST00000519651 ZBTB34Q8NCN2 500 aa14.6□□□□□ -0.07
TSNARE1-204ENST00000519651 TMED6Q8WW62 240 aa14.6□□□□□ -0.07
TSNARE1-204ENST00000519651 PLPPR2Q96GM1 343 aa14.6□□□□□ -0.07
TSNARE1-204ENST00000519651 MAGT1Q9H0U3 335 aa14.6□□□□□ -0.07
TSNARE1-204ENST00000519651 NBEAQ8NFP9 2946 aa14.6□□□□□ -0.07
TSNARE1-204ENST00000519651 POLEQ07864 2286 aa14.59□□□□□ -0.07
TSNARE1-204ENST00000519651 A0A1B0GW55 424 aa14.59□□□□□ -0.07
TSNARE1-204ENST00000519651 NXPH3O95157 252 aa14.59□□□□□ -0.07
TSNARE1-204ENST00000519651 ADH4P08319 380 aa14.59□□□□□ -0.07
TSNARE1-204ENST00000519651 DUX4L2P0CJ85 424 aa14.59□□□□□ -0.07
TSNARE1-204ENST00000519651 DUX4L3P0CJ86 424 aa14.59□□□□□ -0.07
TSNARE1-204ENST00000519651 DUX4L4P0CJ87 422 aa14.59□□□□□ -0.07
TSNARE1-204ENST00000519651 DUX4L5P0CJ88 424 aa14.59□□□□□ -0.07
TSNARE1-204ENST00000519651 DUX4L6P0CJ89 424 aa14.59□□□□□ -0.07
TSNARE1-204ENST00000519651 DUX4L7P0CJ90 424 aa14.59□□□□□ -0.07
TSNARE1-204ENST00000519651 SELLP14151 372 aa14.59□□□□□ -0.07
TSNARE1-204ENST00000519651 ID4P47928 161 aa14.59□□□□□ -0.07
TSNARE1-204ENST00000519651 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
TSNARE1-204ENST00000519651 HTD2P86397 168 aa14.59□□□□□ -0.07
TSNARE1-204ENST00000519651 TLE1Q04724 770 aa14.59□□□□□ -0.07
TSNARE1-204ENST00000519651 TOR2AQ5JU69 321 aa14.59□□□□□ -0.07
TSNARE1-204ENST00000519651 NCMAPQ5T1S8 102 aa14.59□□□□□ -0.07
TSNARE1-204ENST00000519651 GPR157Q5UAW9 335 aa14.59□□□□□ -0.07
TSNARE1-204ENST00000519651 GPR146Q96CH1 333 aa14.59□□□□□ -0.07
TSNARE1-204ENST00000519651 COQ3Q9NZJ6 369 aa14.59□□□□□ -0.07
TSNARE1-204ENST00000519651 DUX4Q9UBX2 424 aa14.59□□□□□ -0.07
TSNARE1-204ENST00000519651 A0A0G2JRQ6 117 aa14.59□□□□□ -0.07
TSNARE1-204ENST00000519651 RNF212BA8MTL3 300 aa14.59□□□□□ -0.07
TSNARE1-204ENST00000519651 GPR137BO60478 399 aa14.59□□□□□ -0.07
TSNARE1-204ENST00000519651 IGKV1-39P01597 117 aa14.59□□□□□ -0.07
TSNARE1-204ENST00000519651 IGKV1D-39P04432 117 aa14.59□□□□□ -0.07
TSNARE1-204ENST00000519651 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
TSNARE1-204ENST00000519651 CHRNB4P30926 498 aa14.59□□□□□ -0.07
TSNARE1-204ENST00000519651 P2RX3P56373 397 aa14.59□□□□□ -0.07
TSNARE1-204ENST00000519651 ZNF585BQ52M93 769 aa14.59□□□□□ -0.07
TSNARE1-204ENST00000519651 LINC01560Q8TB33 94 aa14.59□□□□□ -0.07
TSNARE1-204ENST00000519651 REG4Q9BYZ8 158 aa14.59□□□□□ -0.07
TSNARE1-204ENST00000519651 DCAF16Q9NXF7 216 aa14.59□□□□□ -0.07
TSNARE1-204ENST00000519651 NDRG3Q9UGV2 375 aa14.59□□□□□ -0.07
TSNARE1-204ENST00000519651 SHISA9B4DS77 424 aa14.58□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 SSSCA1O60232 199 aa14.58□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 GYPAP02724 150 aa14.58□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 AKR1C2P52895 323 aa14.58□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 ID3Q02535 119 aa14.58□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 STUMQ69YW2 141 aa14.58□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 MFSD2BA6NFX1 497 aa14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 LRRC30A6NM36 301 aa14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 JTBO76095 146 aa14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 CD55P08174 381 aa14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 NHLH2Q02577 135 aa14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 CR1LQ2VPA4 569 aa14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 NEUROG1Q92886 237 aa14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 SDSLQ96GA7 329 aa14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 ABHD14BQ96IU4 210 aa14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 CCL13Q99616 98 aa14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 OR6C3Q9NZP0 311 aa14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 GNG12Q9UBI6 72 aa14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 PSG11Q9UQ72 335 aa14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 A0A1B0GU03 582 aa14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 E7EQL1 145 aa14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 WRBO00258 174 aa14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 ST8SIA5O15466 376 aa14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 CAV2P51636 162 aa14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 LY6DQ14210 128 aa14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 OR2C3Q8N628 320 aa14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 RNF141Q8WVD5 230 aa14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 EGLN1Q9GZT9 426 aa14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 ZNF665Q9H7R5 613 aa14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 SAP30LQ9HAJ7 183 aa14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 ROS1P08922 2347 aa14.57□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 PIEZO1Q92508 2521 aa14.56□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 FAM24AA6NFZ4 105 aa14.56□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 OMGP23515 440 aa14.56□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 RPL30P62888 115 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 VAMP2P63027 116 aa14.56□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 BTNL3Q6UXE8 466 aa14.56□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 C14orf79Q96F83 325 aa14.56□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 C5orf30Q96GV9 206 aa14.56□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 CHST1O43916 411 aa14.56□□□□□ -0.08
TSNARE1-204ENST00000519651 CD3EP07766 207 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms