RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 GPR61Q9BZJ8 451 aa10.88□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 OR14J1Q9UGF5 321 aa10.88□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 CST7O76096 145 aa10.87□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 NXPH2O95156 264 aa10.87□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 IGHG3P01860 377 aa10.87□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 RPS23P62266 143 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 HMGN3Q15651 99 aa10.87□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 LINC00596Q86U02 117 aa10.87□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 ODF3L1Q8IXM7 274 aa10.87□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 CMTM1Q8IZ96 169 aa10.87□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 SCRT1Q9BWW7 348 aa10.87□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa10.87□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa10.87□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa10.87□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 LRP5LA4QPB2 252 aa10.87□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 WNT9BO14905 357 aa10.87□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 PSG2P11465 335 aa10.87□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 F2RP25116 425 aa10.87□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 ERVK11-1P61568 191 aa10.87□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 WDR31Q8NA23 367 aa10.87□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 KCNJ16Q9NPI9 418 aa10.87□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 GLRX2Q9NS18 164 aa10.87□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 DOK5Q9P104 306 aa10.87□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa10.87□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 GATCO43716 136 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 OR2C1O95371 312 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 CXCL1P09341 107 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 TESK1Q15569 626 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 ZNF674Q2M3X9 581 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 SSX9Q7RTT3 188 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 TMEM217Q8N7C4 229 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 TMEM171Q8WVE6 324 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 WRBO00258 174 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 CHST1O43916 411 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 IGLV2-14P01704 120 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 FOSL1P15407 271 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 VDAC1P21796 283 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 CCL20P78556 96 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 OR8G1Q15617 311 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 Q6ZT83 130 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 COMMD1Q8N668 190 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 TMEM252Q8N6L7 170 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 GPR146Q96CH1 333 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 OBP2BQ9NPH6 170 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 TAAR3PQ9P1P4 343 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 DOCK11Q5JSL3 2073 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 ATMQ13315 3056 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 MLNRO43193 412 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 PGA5P0DJD9 388 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 RAC2P15153 192 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 GUSBP1Q15486 140 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 ZNF497Q6ZNH5 498 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 Q6ZRM9 215 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 TCEAL7Q9BRU2 100 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 PRDM13Q9H4Q3 707 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 DMRT1Q9Y5R6 373 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 H0Y980 276 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 HSPA12AO43301 675 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 SOD3P08294 240 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 CD82P27701 267 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 FABP6P51161 128 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 ID3Q02535 119 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 HAGHQ16775 308 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 ALKBH2Q6NS38 261 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 OR10V1Q8NGI7 309 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 OR5D13Q8NGL4 314 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 OR2G3Q8NGZ4 309 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 SPIN2AQ99865 258 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 CABLES2Q9BTV7 478 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 PBDC1Q9BVG4 233 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 SLC35B3Q9H1N7 401 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 PLCE1Q9P212 2302 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 H3BP45 60 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 PSPNO60542 156 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 IGKV1-39P01597 117 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 IGKV1D-39P04432 117 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 DYNLT3P51808 116 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 VAMP2P63027 116 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 TLE1Q04724 770 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 TAAR6Q96RI8 345 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 UFSP2Q9NUQ7 469 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 IQCF6A8MYZ5 107 aa10.84□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 SERPINE2P07093 398 aa10.84□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 ATP6V0CP27449 155 aa10.84□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 RAB5CP51148 216 aa10.84□□□□□ -0.67
PRAME-213ENST00000492657 PAX9P55771 341 aa10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms