RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490808.1

HDAC3-210, Transcript of histone deacetylase 3, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC3, Length 605 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3-210ENST00000490808 TMEM222Q9H0R3 208 aa8.57□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 RDH8Q9NYR8 311 aa8.57□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 PPIAL4AQ9Y536 164 aa8.57□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 DNHD1Q96M86 4753 aa8.57□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 DYSFO75923 2080 aa8.57□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 VPS13CQ709C8 3753 aa8.57□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa8.56□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa8.56□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa8.56□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 ODAMA1E959 279 aa8.56□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 C3orf80F5H4A9 247 aa8.56□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 H0Y980 276 aa8.56□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 CCSO14618 274 aa8.56□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 HSD17B6O14756 317 aa8.56□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 ARPC5O15511 151 aa8.56□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 ZNF737O75373 536 aa8.56□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 RP2O75695 350 aa8.56□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 MPC2O95563 127 aa8.56□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 CDS2O95674 445 aa8.56□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 HBZP02008 142 aa8.56□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 SERPINE2P07093 398 aa8.56□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 EGR1P18146 543 aa8.56□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 PPOXP50336 477 aa8.56□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 P2RX3P56373 397 aa8.56□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 EDDM3BP56851 147 aa8.56□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 EDDM3AQ14507 147 aa8.56□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 ZNF345Q14585 488 aa8.56□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 OPCMLQ14982 345 aa8.56□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 CR1LQ2VPA4 569 aa8.56□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 HFEQ30201 348 aa8.56□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 SPNS3Q6ZMD2 512 aa8.56□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 Q6ZPA2 131 aa8.56□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa8.56□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa8.56□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 LDLRAD3Q86YD5 345 aa8.56□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 MUC15Q8N387 334 aa8.56□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 ZNF645Q8N7E2 425 aa8.56□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 OR11H4Q8NGC9 324 aa8.56□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 OR8H1Q8NGG4 311 aa8.56□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 SHARPINQ9H0F6 387 aa8.56□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 RAB1BQ9H0U4 201 aa8.56□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 LIME1Q9H400 295 aa8.56□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 OR2S2Q9NQN1 319 aa8.56□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 CCL28Q9NRJ3 127 aa8.56□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 JPT1Q9UK76 154 aa8.56□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 KCNS2Q9ULS6 477 aa8.56□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 HIVEP1P15822 2718 aa8.55□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 hADV38S2A0JD32 116 aa8.55□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 C12orf77C9JDV5 145 aa8.55□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 TMEM178BH3BS89 294 aa8.55□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 SIGLEC5O15389 551 aa8.55□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 ADAP1O75689 374 aa8.55□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 FSTL3O95633 263 aa8.55□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 DANCRP0C864 163 aa8.55□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 F2RP25116 425 aa8.55□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 CD80P33681 288 aa8.55□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 GLIPR1P48060 266 aa8.55□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 RAB7AP51149 207 aa8.55□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 RAB14P61106 215 aa8.55□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa8.55□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 LRRC10Q5BKY1 277 aa8.55□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 GGNBP1Q5YKI7 109 aa8.55□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 STUMQ69YW2 141 aa8.55□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa8.55□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 PRSS54Q6PEW0 395 aa8.55□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 ZNF788Q6ZQV5 615 aa8.55□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 TMUB2Q71RG4 321 aa8.55□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 OR10A7Q8NGE5 316 aa8.55□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 MRGPRDQ8TDS7 321 aa8.55□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 GLYATL2Q8WU03 294 aa8.55□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 COQ2Q96H96 371 aa8.55□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 ABHD14BQ96IU4 210 aa8.55□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 TMEM56Q96MV1 263 aa8.55□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 CCL19Q99731 98 aa8.55□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 ARL6Q9H0F7 186 aa8.55□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 UBTD1Q9HAC8 227 aa8.55□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 PLSCR3Q9NRY6 295 aa8.55□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 CBLN4Q9NTU7 201 aa8.55□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 TMEM106BQ9NUM4 274 aa8.55□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 GSKIPQ9P0R6 139 aa8.55□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 LAMP3Q9UQV4 416 aa8.55□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 MAB21L2Q9Y586 359 aa8.55□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa8.55□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 NF1P21359 2839 aa8.55□□□□□ -1.04
HDAC3-210ENST00000490808 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa8.54□□□□□ -1.04
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