RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489485.5

CLDN11-209, Transcript of claudin 11, humanhuman

TSL 2

Gene CLDN11, Length 1,854 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11-209ENST00000489485 OR52L2PQ8NGH6 319 aa11.66□□□□□ -0.54
CLDN11-209ENST00000489485 OR10J5Q8NHC4 309 aa11.66□□□□□ -0.54
CLDN11-209ENST00000489485 TBX15Q96SF7 602 aa11.66□□□□□ -0.54
CLDN11-209ENST00000489485 SLC6A7Q99884 636 aa11.66□□□□□ -0.54
CLDN11-209ENST00000489485 GINS4Q9BRT9 223 aa11.66□□□□□ -0.54
CLDN11-209ENST00000489485 LINC00574Q9H8X3 128 aa11.66□□□□□ -0.54
CLDN11-209ENST00000489485 OR1A1Q9P1Q5 309 aa11.66□□□□□ -0.54
CLDN11-209ENST00000489485 ZNF221Q9UK13 617 aa11.66□□□□□ -0.54
CLDN11-209ENST00000489485 PEX14O75381 377 aa11.65□□□□□ -0.54
CLDN11-209ENST00000489485 IGHV3-7P01780 117 aa11.65□□□□□ -0.54
CLDN11-209ENST00000489485 CTXN2P0C2S0 81 aa11.65□□□□□ -0.54
CLDN11-209ENST00000489485 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CLDN11-209ENST00000489485 ZBTB25P24278 435 aa11.65□□□□□ -0.54
CLDN11-209ENST00000489485 ASAH1Q13510 395 aa11.65□□□□□ -0.54
CLDN11-209ENST00000489485 MEF2DQ14814 521 aa11.65□□□□□ -0.54
CLDN11-209ENST00000489485 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa11.65□□□□□ -0.54
CLDN11-209ENST00000489485 VAX1Q5SQQ9 334 aa11.65□□□□□ -0.54
CLDN11-209ENST00000489485 OR51S1Q8NGJ8 323 aa11.65□□□□□ -0.54
CLDN11-209ENST00000489485 LHX4Q969G2 390 aa11.65□□□□□ -0.54
CLDN11-209ENST00000489485 SUCNR1Q9BXA5 334 aa11.65□□□□□ -0.54
CLDN11-209ENST00000489485 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CLDN11-209ENST00000489485 GNG12Q9UBI6 72 aa11.65□□□□□ -0.54
CLDN11-209ENST00000489485 SESN1Q9Y6P5 492 aa11.65□□□□□ -0.54
CLDN11-209ENST00000489485 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa11.64□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 F2RL2O00254 374 aa11.64□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 ZNF735P0CB33 412 aa11.64□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 S100A1P23297 94 aa11.64□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 COX7A1P24310 79 aa11.64□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 FCGR2CP31995 323 aa11.64□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 CEACAM6P40199 344 aa11.64□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 KLRD1Q13241 179 aa11.64□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 OR10A7Q8NGE5 316 aa11.64□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 OR10V1Q8NGI7 309 aa11.64□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 DEDD2Q8WXF8 326 aa11.64□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 LEAP2Q969E1 77 aa11.64□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 UPRTQ96BW1 309 aa11.64□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 CABLES2Q9BTV7 478 aa11.64□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 TMEM133Q9H2Q1 129 aa11.64□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa11.64□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 MTORP42345 2549 aa11.64□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 TRAV40A0A0B4J280 105 aa11.63□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 DISC1C4P0D8 188 aa11.63□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 CCR6P51684 374 aa11.63□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 LOXL3P58215 753 aa11.63□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 HTD2P86397 168 aa11.63□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 GNMTQ14749 295 aa11.63□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 UTF1Q5T230 341 aa11.63□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 OR6F1Q8NGZ6 308 aa11.63□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 TNFRSF14Q92956 283 aa11.63□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa11.63□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa11.63□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 BTCP35070 178 aa11.63□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 FAM120AOSQ5T036 256 aa11.63□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 GPR157Q5UAW9 335 aa11.63□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 NCR3LG1Q68D85 454 aa11.63□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 DHRS11Q6UWP2 260 aa11.63□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 IDO2Q6ZQW0 420 aa11.63□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 NRARPQ7Z6K4 114 aa11.63□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 TMEM17Q86X19 198 aa11.63□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 ABHD12Q8N2K0 398 aa11.63□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 PNKDQ8N490 385 aa11.63□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 ARRDC1Q8N5I2 433 aa11.63□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 OR13D1Q8NGV5 346 aa11.63□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 GFOD1Q9NXC2 390 aa11.63□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 RDH8Q9NYR8 311 aa11.63□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa11.62□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 A0A1W2PRD5 423 aa11.62□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 A0A1W2PRF3 423 aa11.62□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 A0A1W2PRM7 423 aa11.62□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 NAP1L6A6NFF2 107 aa11.62□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 GNG10P50151 68 aa11.62□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 MZT2BQ6NZ67 158 aa11.62□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 IL17RELQ6ZVW7 336 aa11.62□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 OR52M1Q8NGK5 317 aa11.62□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 PRRT1Q99946 306 aa11.62□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 CLEC7AQ9BXN2 247 aa11.62□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 ZNF69Q9UC07 566 aa11.62□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa11.62□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 JPT1Q9UK76 154 aa11.62□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 NAV3Q8IVL0 2385 aa11.62□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa11.61□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa11.61□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 RGS13O14921 159 aa11.61□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 DIRAS3O95661 229 aa11.61□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa11.61□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 FXYD4P59646 89 aa11.61□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 TMEM30BQ3MIR4 351 aa11.61□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 MORN2Q502X0 79 aa11.61□□□□□ -0.55
CLDN11-209ENST00000489485 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms