RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486199.5

PHF20L1-215, Transcript of PHD finger protein 20 like 1, human

TSL 2

Gene PHF20L1, Length 1,633 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PHF20L1-215	ENST00000486199	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199		K7EPK0	472 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	ARPC5	O15511	151 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	PI15	O43692	258 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	PFDN1	O60925	122 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	KBTBD11	O94819	623 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	TRBV12-3	P01733	135 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	SERPINA7	P05543	415 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	COX7A1	P24310	79 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	OR3A4P	P47883	348 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	SMIM8	Q96KF7	97 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	SI	P14410	1827 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	CIB4	A0PJX0	185 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	PGP	A6NDG6	321 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	SPAG7	O75391	227 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	MT-CO2	P00403	227 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	HBZ	P02008	142 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	REG1A	P05451	166 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	OR10J4	P0C629	311 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	ZNF708	P17019	499 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	CXCL3	P19876	107 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	KLK2	P20151	261 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	MARCKSL1	P49006	195 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	RIPPLY3	P57055	190 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	ESRRG	P62508	458 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	PSPH	P78330	225 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	HPCA	P84074	193 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	ZNF45	Q02386	682 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	ADIG	Q0VDE8	80 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	ELP2	Q6IA86	826 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199		Q9H3A6	140 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	MARCH5	Q9NX47	278 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	PTPRS	Q13332	1948 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PHF20L1-215	ENST00000486199	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-215	ENST00000486199	MYH8	P13535	1937 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-215	ENST00000486199	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-215	ENST00000486199	C5orf49	A4QMS7	147 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-215	ENST00000486199		A8MXK9	166 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-215	ENST00000486199	FAM72C	H0Y354	149 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-215	ENST00000486199		H3BP45	60 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-215	ENST00000486199	PEX7	O00628	323 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-215	ENST00000486199	EDIL3	O43854	480 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-215	ENST00000486199	ORC5	O43913	435 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-215	ENST00000486199	PDE6D	O43924	150 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-215	ENST00000486199	DHRS3	O75911	302 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-215	ENST00000486199	OR2A4	O95047	310 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-215	ENST00000486199	CA2	P00918	260 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-215	ENST00000486199	FABP3	P05413	133 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-215	ENST00000486199	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-215	ENST00000486199	ESD	P10768	282 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-215	ENST00000486199	PGAM2	P15259	253 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-215	ENST00000486199	CXCL2	P19875	107 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-215	ENST00000486199	PRTN3	P24158	256 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-215	ENST00000486199	CDC42	P60953	191 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-215	ENST00000486199	RAB2A	P61019	212 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-215	ENST00000486199	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-215	ENST00000486199	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-215	ENST00000486199	C6orf99	Q4VX62	202 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-215	ENST00000486199	CENPW	Q5EE01	88 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-215	ENST00000486199	FAM72A	Q5TYM5	149 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-215	ENST00000486199	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-215	ENST00000486199	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-215	ENST00000486199	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-215	ENST00000486199	PCSK4	Q6UW60	755 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-215	ENST00000486199	FAM72B	Q86X60	149 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-215	ENST00000486199	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-215	ENST00000486199	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PHF20L1-215	ENST00000486199	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69

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