RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478080.5

CDHR3-211, Transcript of cadherin related family member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CDHR3, Length 2,633 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR3-211ENST00000478080 PLPPR2Q96GM1 343 aa7.45□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 C5orf30Q96GV9 206 aa7.45□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 SPIN2AQ99865 258 aa7.45□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa7.45□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa7.45□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 ZFP57Q9NU63 452 aa7.45□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 WASF3Q9UPY6 502 aa7.45□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa7.45□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa7.45□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 CLEC18AA5D8T8 446 aa7.45□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 DEFB108AA8MXU0 73 aa7.45□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 WRBO00258 174 aa7.45□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 HBZP02008 142 aa7.45□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 LMO1P25800 156 aa7.45□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 DYNLT3P51808 116 aa7.45□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 EDDM3AQ14507 147 aa7.45□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 LTC4SQ16873 150 aa7.45□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 SWI5Q1ZZU3 235 aa7.45□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 MIDNQ504T8 468 aa7.45□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 C1orf185Q5T7R7 199 aa7.45□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa7.45□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 ZFP82Q8N141 532 aa7.45□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 CLEC18CQ8NCF0 446 aa7.45□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 OR13A1Q8NGR1 328 aa7.45□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 OR5C1Q8NGR4 320 aa7.45□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 PARP11Q9NR21 331 aa7.45□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 CACNG5Q9UF02 275 aa7.45□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 RNF115Q9Y4L5 304 aa7.45□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa7.44□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 RAMP3O60896 148 aa7.44□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 PITX3O75364 302 aa7.44□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 DANCRP0C864 163 aa7.44□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 BMP5P22003 454 aa7.44□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 S100GP29377 79 aa7.44□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 CTAG1AP78358 180 aa7.44□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 KRBOX4Q5JUW0 171 aa7.44□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 FAM201AQ5SY85 155 aa7.44□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 BTNL3Q6UXE8 466 aa7.44□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 GALMQ96C23 342 aa7.44□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 ABHD17AQ96GS6 310 aa7.44□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 OR2D2Q9H210 308 aa7.44□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa7.44□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 KCNIP1Q9NZI2 227 aa7.44□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 CACFD1Q9UGQ2 172 aa7.44□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 APC2O95996 2303 aa7.44□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 ACACAQ13085 2346 aa7.44□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 SPRY3O43610 288 aa7.44□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 PRH1P02810 166 aa7.44□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 SEC11BP0C7V7 166 aa7.44□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 IAPPP10997 89 aa7.44□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 IL2RGP31785 369 aa7.44□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 CAMLGP49069 296 aa7.44□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 RPL30P62888 115 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 RUNX1Q01196 453 aa7.44□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 C2CD4CQ8TF44 421 aa7.44□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 IL22RA2Q969J5 263 aa7.44□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 LRFN3Q9BTN0 628 aa7.44□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa7.44□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa7.44□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa7.43□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 IGHV3-13P01766 116 aa7.43□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 IGHV3-7P01780 117 aa7.43□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 SFTA3P0C7M3 94 aa7.43□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 ATP6V0CP27449 155 aa7.43□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 F2RL1P55085 397 aa7.43□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 SLC35E4Q6ICL7 350 aa7.43□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa7.43□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 OOEPA6NGQ2 149 aa7.43□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 TSPAN15O95858 294 aa7.43□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 PRDX2P32119 198 aa7.43□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 TIMM23BQ5SRD1 257 aa7.43□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 C10orf91Q5T1B1 145 aa7.43□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 MOGAT3Q86VF5 341 aa7.43□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 LYPD6BQ8NI32 183 aa7.43□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 FAM213BQ8TBF2 198 aa7.43□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 ABHD14BQ96IU4 210 aa7.43□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 AKR1E2Q96JD6 320 aa7.43□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 OR2V2Q96R30 315 aa7.43□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 C19orf12Q9NSK7 152 aa7.43□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa7.43□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 ZGRF1Q86YA3 2104 aa7.43□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 USF3Q68DE3 2245 aa7.42□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 RELNP78509 3460 aa7.42□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 A0A1B0GU03 582 aa7.42□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 NUDT19A8MXV4 375 aa7.42□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 TXNL1O43396 289 aa7.42□□□□□ -1.22
CDHR3-211ENST00000478080 CRYAAP02489 173 aa7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms