RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476251.1

CLASP2-211, Transcript of cytoplasmic linker associated protein 2, human

TSL 5

Gene CLASP2, Length 1,097 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLASP2-211	ENST00000476251	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	LYPD6	Q86Y78	171 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	BATF2	Q8N1L9	274 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	LRRC25	Q8N386	305 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	NECAP1	Q8NC96	275 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	OTOS	Q8NHW6	89 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	ZNF596	Q8TC21	504 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	ULBP3	Q9BZM4	244 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	PARL	Q9H300	379 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	NAA60	Q9H7X0	242 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	CALHM2	Q9HA72	323 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	TAC3	Q9UHF0	121 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	UTRN	P46939	3433 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	IGSF23	A1L1A6	192 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	WIPF3	A6NGB9	483 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	C4orf47	A7E2U8	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	HIDE1	A8MVS5	230 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	CORT	O00230	105 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	OR7C2	O60412	319 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	TBL1X	O60907	577 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	GOSR1	O95249	250 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	GYPA	P02724	150 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	ISG15	P05161	165 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	NGFR	P08138	427 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	H2BFM	P0C1H6	154 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	SMIM17	P0DL12	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	PSG1	P11464	419 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	GNB3	P16520	340 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	GZMH	P20718	246 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	HIST1H1T	P22492	207 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	MC5R	P33032	325 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	CDKN1A	P38936	164 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	SLC6A8	P48029	635 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	BID	P55957	195 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	SELENOV	P59797	346 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	QRFP	P83859	136 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	FAM27E3	Q08E93	113 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	NFATC4	Q14934	902 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251		Q5PR19	223 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	CST9LP1	Q5W188	147 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	AMZ2	Q86W34	360 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	OR4S2	Q8NH73	311 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	KCNS1	Q96KK3	526 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	ATP6V0B	Q99437	205 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	SDF2	Q99470	211 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251		R4GMQ9	66 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	VWA8	A3KMH1	1905 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	COL4A6	Q14031	1691 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251		A0A1B0GTH9	108 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	LAT	O43561	262 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	HCRTR1	O43613	425 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	ZNF253	O75346	499 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	SERF1A	O75920	110 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	IFNA5	P01569	189 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	REG1A	P05451	166 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLASP2-211	ENST00000476251	CD55	P08174	381 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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