RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 IGHV1-46P01743 117 aa3.33□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 TPT1P13693 172 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 EPHA1P21709 976 aa3.33□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 CD80P33681 288 aa3.33□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 SSTR5P35346 364 aa3.33□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 CCL8P80075 99 aa3.33□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 GNMTQ14749 295 aa3.33□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 ADAM5Q6NVV9 412 aa3.33□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 BAP18Q8IXM2 172 aa3.33□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 OR10Z1Q8NGY1 313 aa3.33□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 TMED6Q8WW62 240 aa3.33□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 NINJ1Q92982 152 aa3.33□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 PLPPR2Q96GM1 343 aa3.33□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa3.33□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 MAGT1Q9H0U3 335 aa3.33□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC25A32Q9H2D1 315 aa3.33□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 JKAMPQ9P055 326 aa3.33□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 E5RGE8 158 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 H0Y980 276 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 IGLV2-14P01704 120 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 OR4A8P0C604 315 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 SELLP14151 372 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 VDAC1P21796 283 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 TNFSF4P23510 183 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 CASP6P55212 293 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 EDDM3BP56851 147 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM33P57088 247 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 AANATQ16613 207 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 TOR2AQ5JU69 321 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 DRAM1Q8N682 238 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 PPP1R35Q8TAP8 253 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 ERGIC1Q969X5 290 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 VKORC1Q9BQB6 163 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 GCM1Q9NP62 436 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 SDHAF2Q9NX18 166 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 RNF7Q9UBF6 113 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 NSG2Q9Y328 171 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 AUP1Q9Y679 476 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF737O75373 536 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 FBXO24O75426 580 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 C1QTNF9P0C862 333 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 CFHR2P36980 270 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 KLRB1Q12918 225 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 ADIPOQQ15848 244 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 OR2B11Q5JQS5 317 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 C16orf54Q6UWD8 224 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 OR5D13Q8NGL4 314 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 OR4D5Q8NGN0 318 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 PHYHIPLQ96FC7 376 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 AKR1E2Q96JD6 320 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 SNX22Q96L94 193 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 SPIN2AQ99865 258 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 OR2D2Q9H210 308 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 PLEKHA2Q9HB19 425 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 ZFP57Q9NU63 452 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 DCAF16Q9NXF7 216 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 FBXL17Q9UF56 701 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 IL19Q9UHD0 177 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 PIEZO1Q92508 2521 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 RELNP78509 3460 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A0G2JRQ6 117 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 ODAMA1E959 279 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM24AA6NFZ4 105 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM90A27PA6NNH2 459 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 LGALS8O00214 317 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 CCL21O00585 134 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 MGST3O14880 152 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 SPINT2O43291 252 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 LHBP01229 141 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 IGHV3-7P01780 117 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 IRF2P14316 349 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 OMGP23515 440 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 CAV2P51636 162 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 AKR1C2P52895 323 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 P2RX3P56373 397 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 NHLH2Q02577 135 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 NMSQ5H8A3 153 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 NUP37Q8NFH4 326 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 DMBX1Q8NFW5 382 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 ANGPTL6Q8NI99 470 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 STOML3Q8TAV4 291 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM4-201ENST00000409088 GPR146Q96CH1 333 aa3.32□□□□□ -1.88
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