RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 CD55P08174 381 aa5.8□□□□□ -1.48
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RABGEF1-202ENST00000380828 SRIP30626 198 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 CCL11P51671 97 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP5.8□□□□□ -1.48
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RABGEF1-202ENST00000380828 PLK5Q496M5 336 aa5.8□□□□□ -1.48
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RABGEF1-202ENST00000380828 J3KTA2 159 aa5.8□□□□□ -1.48
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RABGEF1-202ENST00000380828 CD99P14209 185 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 ATP6V0CP27449 155 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 TGFBR3Q03167 851 aa5.8□□□□□ -1.48
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RABGEF1-202ENST00000380828 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 OR5AN1Q8NGI8 311 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC25A38Q96DW6 304 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 WNT10AQ9GZT5 417 aa5.8□□□□□ -1.48
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RABGEF1-202ENST00000380828 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 E9PLN8 166 aa5.79□□□□□ -1.48
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RABGEF1-202ENST00000380828 FAM236CP0DP71 79 aa5.79□□□□□ -1.48
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RABGEF1-202ENST00000380828 ZIC4Q8N9L1 334 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF114Q8NC26 417 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 OR10G2Q8NGC3 310 aa5.79□□□□□ -1.48
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RABGEF1-202ENST00000380828 MALLQ13021 153 aa5.79□□□□□ -1.48
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RABGEF1-202ENST00000380828 VWC2Q2TAL6 325 aa5.79□□□□□ -1.48
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RABGEF1-202ENST00000380828 TCEANCQ8N8B7 351 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 OR13C6PQ8NH95 151 aa5.79□□□□□ -1.48
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