RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373433.8

RPRD1B-201, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPRD1B, Length 3,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-201ENST00000373433 A0A1B0GU03 582 aa9.61□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 A0A1W2PPQ1 181 aa9.61□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 CRYABP02511 175 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 NPSP0C0P6 89 aa9.61□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 CEACAM6P40199 344 aa9.61□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 MKXQ8IYA7 352 aa9.61□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 TMEM252Q8N6L7 170 aa9.61□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 PRR14LQ5THK1 2151 aa9.61□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 SPEGQ15772 3267 aa9.61□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 CEBPZOSA8MTT3 80 aa9.61□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 PPP5D1E7EU14 171 aa9.61□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 HS3ST1O14792 307 aa9.61□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 ZIC3O60481 467 aa9.61□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 LYZL6O75951 148 aa9.61□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 GCGP01275 180 aa9.61□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 CELA3AP09093 270 aa9.61□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF154Q13106 437 aa9.61□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 TEX38Q6PEX7 206 aa9.61□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 FAM89BQ8N5H3 189 aa9.61□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 DEPPQ9NTK1 212 aa9.61□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 PRRG2O14669 202 aa9.6□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 NPIPB7O75200 414 aa9.6□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 IQCJQ1A5X6 159 aa9.6□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 POC1BQ8TC44 478 aa9.6□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 TMEM18Q96B42 140 aa9.6□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 GPHA2Q96T91 129 aa9.6□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 TMEM208Q9BTX3 173 aa9.6□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa9.6□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF581Q9P0T4 197 aa9.6□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 LHFPL6Q9Y693 200 aa9.6□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa9.6□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 C5orf63A6NC05 138 aa9.6□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 PITX3O75364 302 aa9.6□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 IGHV3-13P01766 116 aa9.6□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 IGHV3-7P01780 117 aa9.6□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 HERPUD1Q15011 391 aa9.6□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 FAM90A2PQ658T7 463 aa9.6□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF787Q6DD87 383 aa9.6□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 DOK3Q7L591 496 aa9.6□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF695Q8IW36 515 aa9.6□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 GLRX2Q9NS18 164 aa9.6□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 DLL3Q9NYJ7 618 aa9.6□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 PIGLQ9Y2B2 252 aa9.6□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa9.6□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 MSTNO14793 375 aa9.6□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 NEURL1O76050 574 aa9.6□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 IGHMP01871 453 aa9.6□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 TDGF1P3P51864 188 aa9.6□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 BTNL3Q6UXE8 466 aa9.6□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 EXTL1Q92935 676 aa9.6□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 ADGRG7Q96K78 797 aa9.6□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 OR5B12Q96R08 314 aa9.6□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 TP53RKQ96S44 253 aa9.6□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 FUT9Q9Y231 359 aa9.6□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 CST2P09228 141 aa9.59□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 TUSC5Q8IXB3 177 aa9.59□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 FADS6Q8N9I5 356 aa9.59□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 OR5T1Q8NG75 326 aa9.59□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 PSMF1Q92530 271 aa9.59□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 C18orf12Q96KH6 178 aa9.59□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 FOXB1Q99853 325 aa9.59□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 MOB1AQ9H8S9 216 aa9.59□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 ASCL3Q9NQ33 180 aa9.59□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa9.59□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa9.59□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF814B7Z6K7 855 aa9.59□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 DLEU1O43261 78 aa9.59□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 TK1P04183 234 aa9.59□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 TNFSF10P50591 281 aa9.59□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 RND2P52198 227 aa9.59□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 OR8G5Q8NG78 346 aa9.59□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 C16orf82Q7Z2V1 217 aa9.59□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 DTD1Q8TEA8 209 aa9.59□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 SMIM7Q9BQ49 75 aa9.59□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 SRD5A3Q9H8P0 318 aa9.59□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 M0R135 149 aa9.58□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 RTL6Q6ICC9 239 aa9.58□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF799Q96GE5 643 aa9.58□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 PROB1E7EW31 1015 aa9.58□□□□□ -0.88
RPRD1B-201ENST00000373433 TRAPPC2LH3BP13 241 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.2 ms