RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 ASCL3Q9NQ33 180 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 BMPR1BO00238 502 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 ORM2P19652 201 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 MAGEA5P43359 124 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 SELENOPP49908 381 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 TCTAP57738 103 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 PSG9Q00887 426 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 PSG5Q15238 335 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 MMDQ15546 238 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 OR4D10Q8NGI6 311 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 PRR33A8MZF0 331 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 TSPOP30536 169 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 WDR31Q8NA23 367 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 LPAR2Q9HBW0 351 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 FAM78BQ5VT40 261 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 MUC15Q8N387 334 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 PRDM14Q9GZV8 571 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 TTTY12Q9BZ98 90 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 FLRT3Q9NZU0 649 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 V9GYH0 126 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 LRRK1Q38SD2 2015 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 CDIPTO14735 213 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 FFAR1O14842 300 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 LIPGQ9Y5X9 500 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 METAP1P53582 386 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM50BP56557 158 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 EBLN2Q6P2I7 272 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 COX7A1P24310 79 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 VWA1Q6PCB0 445 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 OR4P4Q8NGL7 312 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 APCSP02743 223 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 GAMTQ14353 236 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 FAM214BQ7L5A3 538 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF645Q8N7E2 425 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 DEFB124Q8NES8 71 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 OR10D4PQ8NGN7 298 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 FGF11Q92914 225 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 STARD4Q96DR4 205 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 NPIPB6E9PJ23 425 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 IGHMP01871 453 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 ASAH2BP0C7U1 165 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 RFESDQ8TAC1 157 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 MGAMO43451 1857 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 PRSS1P07477 247 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 C1orf185Q5T7R7 199 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 SIGIRRQ6IA17 410 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 DCAF16Q9NXF7 216 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 NAT1P18440 290 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 AP5S1Q9NUS5 200 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 DXOO77932 396 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 PIMREGQ9BSJ6 248 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 HLA-DRB5Q30154 266 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 C5orf52A6NGY3 159 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM78Q5T7P6 136 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 OR4X1Q8NH49 305 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 MYOZ3Q8TDC0 251 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 PGLYRP3Q96LB9 341 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 HBZP02008 142 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 CD1BP29016 333 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 C12orf54Q6X4T0 127 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 SPNS3Q6ZMD2 512 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 C9orf62Q8N4C0 152 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 GALNT14Q96FL9 552 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 LPAR5Q9H1C0 372 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 DLX1P56177 255 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 FGF12P61328 243 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 ELOVL5Q9NYP7 299 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 J3QR06 171 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 RPL8P62917 257 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 RRN3P1Q2M238 152 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 CLEC2AQ6UVW9 174 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 PRSS41Q7RTY9 318 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM37Q8WXS4 190 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 C7orf66A4D0T2 115 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF883P0CG24 379 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 FGF5P12034 268 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 OR10J1P30954 320 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 PSMB2P49721 201 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 PKIAP61925 76 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 FAM209BQ5JX69 171 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRT-201ENST00000356100 MRGPRFQ96AM1 343 aa5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms