RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326277.5

SNX18-201, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX18, Length 2,063 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-201ENST00000326277 OR10Z1Q8NGY1 313 aa19.15■□□□□ 0.66
SNX18-201ENST00000326277 SLC25A31Q9H0C2 315 aa19.15■□□□□ 0.66
SNX18-201ENST00000326277 SH3BGRL3Q9H299 93 aa19.15■□□□□ 0.66
SNX18-201ENST00000326277 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa19.14■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa19.14■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 A0A0G2JNJ9 132 aa19.14■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 WRBO00258 174 aa19.14■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 SPRY3O43610 288 aa19.14■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 IGKV1-5P01602 117 aa19.14■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 MMP9P14780 707 aa19.14■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 SSTR5P35346 364 aa19.14■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 ID4P47928 161 aa19.14■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 DEFA5Q01523 94 aa19.14■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 CLINT1Q14677 625 aa19.14■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 GCSAMQ8N6F7 178 aa19.14■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 ZNF645Q8N7E2 425 aa19.14■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa19.14■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 LRRC46Q96FV0 321 aa19.14■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 MEGF10Q96KG7 1140 aa19.14■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 OR2D2Q9H210 308 aa19.14■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 Q9UFV3 132 aa19.14■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 BSNQ9UPA5 3926 aa19.14■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 ZNF737O75373 536 aa19.13■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 CCKARP32238 428 aa19.13■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 CFHR2P36980 270 aa19.13■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 TBR1Q16650 682 aa19.13■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 MOGAT3Q86VF5 341 aa19.13■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 TOLLIPQ9H0E2 274 aa19.13■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 TMEM231Q9H6L2 316 aa19.13■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 ACACAQ13085 2346 aa19.13■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 PAX9P55771 341 aa19.13■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 SWI5Q1ZZU3 235 aa19.13■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 NINJ1Q92982 152 aa19.13■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 C5orf30Q96GV9 206 aa19.13■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 LURAP1Q96LR2 239 aa19.13■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 DCTN5Q9BTE1 182 aa19.13■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 CACNG5Q9UF02 275 aa19.13■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa19.12■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 DANCRP0C864 163 aa19.12■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 ADCYAP1P18509 176 aa19.12■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 EDDM3AQ14507 147 aa19.12■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 RNF212BA8MTL3 300 aa19.12■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 CST7O76096 145 aa19.12■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 CD40P25942 277 aa19.12■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 F2RL1P55085 397 aa19.12■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 PAX5Q02548 391 aa19.12■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 MRGPRGQ86SM5 289 aa19.12■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 FAM90A1Q86YD7 464 aa19.12■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 TREM1Q9NP99 234 aa19.12■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 FAM96BQ9Y3D0 163 aa19.12■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 GFRALQ6UXV0 394 aa19.11■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 ZBTB34Q8NCN2 500 aa19.11■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 OR5C1Q8NGR4 320 aa19.11■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 RFESDQ8TAC1 157 aa19.11■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 ITLN1Q8WWA0 313 aa19.11■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 AGPAT2O15120 278 aa19.1■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 ATG12O94817 140 aa19.1■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 RPS23P62266 143 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 ZNF266Q14584 549 aa19.1■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa19.1■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 LYPD6BQ8NI32 183 aa19.1■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa19.1■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa19.1■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 C15orf65H3BRN8 121 aa19.1■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 K7ENP7 123 aa19.1■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 IGHV3-43DP0DP04 118 aa19.1■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 DYNLT3P51808 116 aa19.1■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 TMEM217Q8N7C4 229 aa19.1■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 LHBP01229 141 aa19.09■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 FHITP49789 147 aa19.09■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 RPL30P62888 115 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 BAXQ07812 192 aa19.09■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 UQCC1Q9NVA1 299 aa19.09■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 CACFD1Q9UGQ2 172 aa19.09■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 CUL9Q8IWT3 2517 aa19.09■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 CACNA1DQ01668 2161 aa19.09■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 CEP295Q9C0D2 2601 aa19.09■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 RAMP3O60896 148 aa19.09■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa19.08■□□□□ 0.65
SNX18-201ENST00000326277 H3BP45 60 aa19.08■□□□□ 0.64
SNX18-201ENST00000326277 SPINT2O43291 252 aa19.08■□□□□ 0.64
SNX18-201ENST00000326277 C1QL1O75973 258 aa19.08■□□□□ 0.64
SNX18-201ENST00000326277 TRAT1Q6PIZ9 186 aa19.08■□□□□ 0.64
SNX18-201ENST00000326277 FGFRL1Q8N441 504 aa19.08■□□□□ 0.64
SNX18-201ENST00000326277 SNX22Q96L94 193 aa19.08■□□□□ 0.64
SNX18-201ENST00000326277 RAB40CQ96S21 281 aa19.08■□□□□ 0.64
SNX18-201ENST00000326277 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
SNX18-201ENST00000326277 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
SNX18-201ENST00000326277 ODAMA1E959 279 aa19.07■□□□□ 0.64
SNX18-201ENST00000326277 DEFB108AA8MXU0 73 aa19.07■□□□□ 0.64
SNX18-201ENST00000326277 F8W036 122 aa19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms