RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 TBC1D26Q86UD7 250 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 LRTM2Q8N967 370 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 OR11H4Q8NGC9 324 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 GLYATL2Q8WU03 294 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM168AQ92567 244 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 GAFA1Q96PS6 74 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 GON7Q9BXV9 100 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM222Q9H0R3 208 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 ZFP57Q9NU63 452 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 C15orf65H3BRN8 121 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 CCSO14618 274 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 ADAP1O75689 374 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 RLN2P04090 185 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 SERPINE2P07093 398 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 F2RP25116 425 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 PSMB6P28072 239 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 MSMO1Q15800 293 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM30BQ3MIR4 351 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 SP6Q3SY56 376 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM65Q6PI78 240 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF695Q8IW36 515 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 OR52L2PQ8NGH6 319 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 UBALD1Q8TB05 177 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 CORO2AQ92828 525 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM56Q96MV1 263 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM246Q9BRR3 403 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 DCAF16Q9NXF7 216 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 GSKIPQ9P0R6 139 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 KAAG1Q9UBP8 84 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 LPAR3Q9UBY5 353 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNS2Q9ULS6 477 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 TMED3Q9Y3Q3 217 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 BSNQ9UPA5 3926 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 CACNA1DQ01668 2161 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 F2RL2O00254 374 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 ADAM20O43506 726 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 YPEL1O60688 119 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 DANCRP0C864 163 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 PET100P0DJ07 73 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 CGB3P0DN86 165 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 CGB7P0DN87 165 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC25A4P12235 298 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 COL8A2P25067 703 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 ESCO2Q56NI9 601 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 CDPF1Q6NVV7 123 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF546Q86UE3 836 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 DTX2Q86UW9 622 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 C9orf62Q8N4C0 152 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM216BQ8N7L0 139 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 TIMD4Q96H15 378 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 YPEL2Q96QA6 119 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 DCTN5Q9BTE1 182 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 SLA2Q9H6Q3 261 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 CALYQ9NYX4 217 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 CLN8Q9UBY8 286 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 JPT1Q9UK76 154 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 RNF150Q9ULK6 438 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 H0Y980 276 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 L7N2F9 121 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 MPC2O95563 127 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 CDS2O95674 445 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 WNT2P09544 360 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 SSTR5P35346 364 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM33P57088 247 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 RPL31P62899 125 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 ABCA4P78363 2273 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 MORN2Q502X0 79 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM268Q5VZI3 342 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 GGNBP1Q5YKI7 109 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 C11orf87Q6NUJ2 197 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 LYZL2Q7Z4W2 148 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF843Q8N446 348 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF645Q8N7E2 425 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-201ENST00000319942 OR10A7Q8NGE5 316 aa8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.9 ms