RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307180.4

TSNARE1-201, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-201ENST00000307180 SELEP16581 610 aa13.31□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 SRPXP78539 464 aa13.31□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 C3orf36Q3SXR2 165 aa13.31□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF880Q6PDB4 577 aa13.31□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 VHLLQ6RSH7 139 aa13.31□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa13.31□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 TBC1D26Q86UD7 250 aa13.31□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 GAPTQ8N292 157 aa13.31□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 OR51M1Q9H341 326 aa13.31□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 ZFP57Q9NU63 452 aa13.31□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa13.31□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 NSG2Q9Y328 171 aa13.31□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 ROS1P08922 2347 aa13.31□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 ERVK11-1P61568 191 aa13.31□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM268Q5VZI3 342 aa13.31□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 Q8IYB0 196 aa13.31□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC35G3Q8N808 338 aa13.31□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 OR4A4PQ8NGN8 299 aa13.31□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 ARID1AO14497 2285 aa13.3□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 E7EQL1 145 aa13.3□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM33P57088 247 aa13.3□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 OR8G1Q15617 311 aa13.3□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 BPIFCQ8NFQ6 507 aa13.3□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 OR52M1Q8NGK5 317 aa13.3□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 LURAP1Q96LR2 239 aa13.3□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM56Q96MV1 263 aa13.3□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 TAF9BQ9HBM6 251 aa13.3□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 CCL28Q9NRJ3 127 aa13.3□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa13.3□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 ITPR2Q14571 2701 aa13.29□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 RAB19A4D1S5 217 aa13.29□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 WRBO00258 174 aa13.29□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 CDIPTO14735 213 aa13.29□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 HSD17B6O14756 317 aa13.29□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP13.29□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 MPV17P39210 176 aa13.29□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF695Q8IW36 515 aa13.29□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 NRIP2Q9BQI9 281 aa13.29□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 FBXL17Q9UF56 701 aa13.29□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 H0YL77 283 aa13.29□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 ST8SIA3O43173 380 aa13.29□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 GRPP07492 148 aa13.29□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 PGA5P0DJD9 388 aa13.29□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 AKAP6Q13023 2319 aa13.29□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF154Q13106 437 aa13.29□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 GPR157Q5UAW9 335 aa13.29□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 OR10J5Q8NHC4 309 aa13.29□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 NANPQ8TBE9 248 aa13.29□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 TREM2Q9NZC2 230 aa13.29□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM210A6NLX4 147 aa13.28□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 SIRPB1O00241 398 aa13.28□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 JTBO76095 146 aa13.28□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 NXPH2O95156 264 aa13.28□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 CDS2O95674 445 aa13.28□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 OR2H2O95918 312 aa13.28□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 IGHV2-70P01814 119 aa13.28□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 MDH2P40926 338 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 HLA-DRB3P79483 266 aa13.28□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 UQCC3Q6UW78 93 aa13.28□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 CMTM1Q8IZ96 169 aa13.28□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 OR4D5Q8NGN0 318 aa13.28□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 GPHA2Q96T91 129 aa13.28□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 LPAR3Q9UBY5 353 aa13.28□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 OR2W1Q9Y3N9 320 aa13.28□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa13.27□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 SH2D1BO14796 132 aa13.27□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 GPR137BO60478 399 aa13.27□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 S100A9P06702 114 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 FABP6P51161 128 aa13.27□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF146Q15072 292 aa13.27□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF124Q15973 351 aa13.27□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF497Q6ZNH5 498 aa13.27□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 OR8G5Q8NG78 346 aa13.27□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 ERGIC1Q969X5 290 aa13.27□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 KIRREL1Q96J84 757 aa13.27□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 SMIM3Q9BZL3 60 aa13.27□□□□□ -0.28
TSNARE1-201ENST00000307180 NUDT19A8MXV4 375 aa13.27□□□□□ -0.29
TSNARE1-201ENST00000307180 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
TSNARE1-201ENST00000307180 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
TSNARE1-201ENST00000307180 P2RY1P47900 373 aa13.27□□□□□ -0.29
TSNARE1-201ENST00000307180 MST1LQ2TV78 715 aa13.27□□□□□ -0.29
TSNARE1-201ENST00000307180 CLEC9AQ6UXN8 241 aa13.27□□□□□ -0.29
TSNARE1-201ENST00000307180 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms