RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000303230.5

HCN1-201, Transcript of hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCN1, Length 9,885 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN1-201ENST00000303230 PAGE4O60829 102 aa14.86□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 ISG15P05161 165 aa14.86□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 AGAP20933 346 aa14.86□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP14.86□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 NPTNQ9Y639 398 aa14.86□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 FRMPD3Q5JV73 1810 aa14.85□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 SMIM13P0DJ93 91 aa14.85□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa14.85□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa14.85□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 TCF24Q7RTU0 167 aa14.85□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 ATP23Q9Y6H3 246 aa14.85□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 LGALS7P47929 136 aa14.85□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 MOB3BQ86TA1 216 aa14.85□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 OBSL1O75147 1896 aa14.85□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 OR8B3Q8NGG8 313 aa14.85□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 RHOVQ96L33 236 aa14.85□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa14.85□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 C10orf126Q8N4M7 172 aa14.85□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 NEUROG1Q92886 237 aa14.85□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 NUDT3O95989 172 aa14.84□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 CEACAM5P06731 702 aa14.84□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 ORM2P19652 201 aa14.84□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 TUBA4BQ9H853 241 aa14.84□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 AQP3Q92482 292 aa14.84□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 MRGPRFQ96AM1 343 aa14.84□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 ZNF260Q3ZCT1 412 aa14.84□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa14.84□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 DEFB103AP81534 67 aa14.84□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 TCF23Q7RTU1 214 aa14.84□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 VSTM2LQ96N03 204 aa14.84□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 SLC17A3O00476 420 aa14.84□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 SOCS7O14512 581 aa14.84□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 CFDP00746 253 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 HSF4Q9ULV5 492 aa14.84□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 SKP2Q13309 424 aa14.84□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 OR4D9Q8NGE8 314 aa14.84□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 ANKRD10Q9NXR5 420 aa14.84□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 SYNGR1O43759 233 aa14.83□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 LIMS2Q7Z4I7 341 aa14.83□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 NIT1Q86X76 327 aa14.83□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 CALHM1Q8IU99 346 aa14.83□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 TMEM30BQ3MIR4 351 aa14.83□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 ALG14Q96F25 216 aa14.83□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 PAXXQ9BUH6 204 aa14.83□□□□□ -0.03
HCN1-201ENST00000303230 SOD3P08294 240 aa14.83□□□□□ -0.04
HCN1-201ENST00000303230 SIT1Q9Y3P8 196 aa14.83□□□□□ -0.04
HCN1-201ENST00000303230 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
HCN1-201ENST00000303230 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
HCN1-201ENST00000303230 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
HCN1-201ENST00000303230 RARRES2Q99969 163 aa14.83□□□□□ -0.04
HCN1-201ENST00000303230 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa14.83□□□□□ -0.04
HCN1-201ENST00000303230 MYOGP15173 224 aa14.82□□□□□ -0.04
HCN1-201ENST00000303230 SFXN3Q9BWM7 321 aa14.82□□□□□ -0.04
HCN1-201ENST00000303230 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa14.82□□□□□ -0.04
HCN1-201ENST00000303230 CA7P43166 264 aa14.82□□□□□ -0.04
HCN1-201ENST00000303230 ARL17AQ8IVW1 177 aa14.82□□□□□ -0.04
HCN1-201ENST00000303230 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa14.82□□□□□ -0.04
HCN1-201ENST00000303230 LIPT2A6NK58 231 aa14.82□□□□□ -0.04
HCN1-201ENST00000303230 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
HCN1-201ENST00000303230 FBXO17Q96EF6 278 aa14.82□□□□□ -0.04
HCN1-201ENST00000303230 TLNRD1Q9H1K6 362 aa14.82□□□□□ -0.04
HCN1-201ENST00000303230 NPVFQ9HCQ7 196 aa14.82□□□□□ -0.04
HCN1-201ENST00000303230 HIGD1AQ9Y241 93 aa14.82□□□□□ -0.04
HCN1-201ENST00000303230 CXCL13O43927 109 aa14.82□□□□□ -0.04
HCN1-201ENST00000303230 CA6P23280 308 aa14.82□□□□□ -0.04
HCN1-201ENST00000303230 RND1Q92730 232 aa14.82□□□□□ -0.04
HCN1-201ENST00000303230 TNCP24821 2201 aa14.82□□□□□ -0.04
HCN1-201ENST00000303230 IL4P05112 153 aa14.82□□□□□ -0.04
HCN1-201ENST00000303230 SRD5A2P31213 254 aa14.82□□□□□ -0.04
HCN1-201ENST00000303230 MPLP40238 635 aa14.82□□□□□ -0.04
HCN1-201ENST00000303230 SSMEM1Q8WWF3 244 aa14.82□□□□□ -0.04
HCN1-201ENST00000303230 OR2J1Q9GZK6 312 aa14.82□□□□□ -0.04
HCN1-201ENST00000303230 HPRT1P00492 218 aa14.82□□□□□ -0.04
HCN1-201ENST00000303230 CD40P25942 277 aa14.82□□□□□ -0.04
HCN1-201ENST00000303230 LYZL2Q7Z4W2 148 aa14.82□□□□□ -0.04
HCN1-201ENST00000303230 LRRC75AQ8NAA5 344 aa14.82□□□□□ -0.04
HCN1-201ENST00000303230 OR10S1Q8NGN2 331 aa14.82□□□□□ -0.04
HCN1-201ENST00000303230 ONECUT1Q9UBC0 465 aa14.82□□□□□ -0.04
HCN1-201ENST00000303230 ZNF32P17041 273 aa14.81□□□□□ -0.04
HCN1-201ENST00000303230 TMEM91Q6ZNR0 172 aa14.81□□□□□ -0.04
HCN1-201ENST00000303230 FAM169BQ8N8A8 192 aa14.81□□□□□ -0.04
HCN1-201ENST00000303230 PCGF1Q9BSM1 259 aa14.81□□□□□ -0.04
HCN1-201ENST00000303230 GABRG2P18507 467 aa14.81□□□□□ -0.04
HCN1-201ENST00000303230 MAP1LC3AQ9H492 121 aa14.81□□□□□ -0.04
HCN1-201ENST00000303230 SPG11Q96JI7 2443 aa14.81□□□□□ -0.04
HCN1-201ENST00000303230 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa14.81□□□□□ -0.04
HCN1-201ENST00000303230 PNLIPP16233 465 aa14.81□□□□□ -0.04
HCN1-201ENST00000303230 ZNF600Q6ZNG1 722 aa14.81□□□□□ -0.04
HCN1-201ENST00000303230 OR2I1PQ8NGU4 316 aa14.81□□□□□ -0.04
HCN1-201ENST00000303230 KLK13Q9UKR3 277 aa14.81□□□□□ -0.04
HCN1-201ENST00000303230 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP14.81□□□□□ -0.04
HCN1-201ENST00000303230 GNG7O60262 68 aa14.81□□□□□ -0.04
HCN1-201ENST00000303230 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms