RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 CLDN14O95500 239 aa18.32■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 C16orf82Q7Z2V1 217 aa18.32■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM251Q8N6I4 163 aa18.32■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 OR2D3Q8NGH3 330 aa18.32■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 SGMS2Q8NHU3 365 aa18.32■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 HSF4Q9ULV5 492 aa18.32■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 ATG2BQ96BY7 2078 aa18.32■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 DHRS7CA6NNS2 312 aa18.32■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 GUCA2BQ16661 112 aa18.32■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 AQP10Q96PS8 301 aa18.32■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 TMUB1Q9BVT8 246 aa18.32■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 PIN1P1O15428 100 aa18.32■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 SMIM10L1P0DMW3 83 aa18.32■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 PRF1P14222 555 aa18.32■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 HERVK_113P61574 105 aa18.32■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 SMIM10Q96HG1 83 aa18.32■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa18.32■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 CIDEAO60543 219 aa18.31■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 KCNE5Q9UJ90 142 aa18.31■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 PATE3B3GLJ2 98 aa18.31■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 P2RY6Q15077 328 aa18.31■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 K7N7A8 449 aa18.31■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 CTHRC1Q96CG8 243 aa18.31■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 PPIAL4EA0A075B759 164 aa18.31■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa18.31■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 PPIAL4DF5H284 164 aa18.31■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 PPIAL4FP0DN26 164 aa18.31■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 RPL7P18124 248 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 UCP2P55851 309 aa18.31■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF273Q14593 569 aa18.31■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 PMS2CLQ68D20 193 aa18.31■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 SLC25A33Q9BSK2 321 aa18.31■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 PPIAL4AQ9Y536 164 aa18.31■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa18.3■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 F12P00748 615 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa18.3■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa18.3■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 DPF1Q92782 380 aa18.3■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 LY75O60449 1722 aa18.3■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 KCNAB3O43448 404 aa18.3■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 HBZP02008 142 aa18.3■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 RTP5Q14D33 572 aa18.3■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 ADIPOR1Q96A54 375 aa18.3■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 PAXXQ9BUH6 204 aa18.3■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 MT-ND6P03923 174 aa18.3■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 FAM209AQ5JX71 171 aa18.3■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 FAM222BQ8WU58 562 aa18.3■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 DIRC2Q96SL1 478 aa18.3■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 LTBP4Q8N2S1 1624 aa18.3■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 SRP14P37108 136 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 FHL5Q5TD97 284 aa18.3■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 FAM214BQ7L5A3 538 aa18.3■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 PXMP4Q9Y6I8 212 aa18.3■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 QSER1Q2KHR3 1735 aa18.29■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 PAFAH1B2P68402 229 aa18.29■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa18.29■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 GCSAMQ8N6F7 178 aa18.29■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 FAM206AQ9NX38 181 aa18.29■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 LAIR2Q6ISS4 152 aa18.29■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 DCAF16Q9NXF7 216 aa18.29■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 LHFPL6Q9Y693 200 aa18.29■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 MMDQ15546 238 aa18.29■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa18.29■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 HYPMO75409 117 aa18.29■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 SCTP09683 121 aa18.29■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 CD99P14209 185 aa18.28■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 SCGB1D4Q6XE38 83 aa18.28■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 PKIBQ9C010 78 aa18.28■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 FGF5P12034 268 aa18.28■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 SELENOTP62341 195 aa18.28■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 HIGD1AQ9Y241 93 aa18.28■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 A6NDN8 102 aa18.28■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 FAM90A26D6RGX4 464 aa18.28■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 HKR1P10072 659 aa18.28■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 FCARP24071 287 aa18.28■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 WNT5AP41221 380 aa18.28■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 FOXL2P58012 376 aa18.28■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 FAM181AQ8N9Y4 354 aa18.28■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 RSG1Q9BU20 258 aa18.28■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 FAM186AA6NE01 2351 aa18.28■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 ERVH48-1M5A8F1 160 aa18.28■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 MIA3Q5JRA6 1907 aa18.27■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 C4orf51C9J302 202 aa18.27■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 OR2H2O95918 312 aa18.27■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 P2RX4Q99571 388 aa18.27■□□□□ 0.52
CCSAP-201ENST00000284617 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 NAT1P18440 290 aa18.27■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 CD40P25942 277 aa18.27■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 MPV17P39210 176 aa18.27■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF645Q8N7E2 425 aa18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 104.5 ms