RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263434.5

PTPRH-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type H, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRH, Length 3,343 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRH-201ENST00000263434 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 ZNF525Q8N782 197 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 CLEC18CQ8NCF0 446 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 C14orf144Q96I85 54 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 PRDM14Q9GZV8 571 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 PRDM6Q9NQX0 595 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 CLN8Q9UBY8 286 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 A0A087X0M5 115 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 A0A1B0GU03 582 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 A0A1B0GX30 115 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 CEACAM6P40199 344 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 PLP2Q04941 152 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 COL19A1Q14993 1142 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 NCR3LG1Q68D85 454 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 OR4F5Q8NH21 305 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 POM121Q96HA1 1249 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 OR4F4Q96R69 305 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 RAB40CQ96S21 281 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 IFNL4K9M1U5 179 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 GRPP07492 148 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 MAGEA5P43359 124 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 LTC4SQ16873 150 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 BTNL3Q6UXE8 466 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 SDF2L1Q9HCN8 221 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 GATCO43716 136 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 CYTIPO60759 359 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 IGKV1D-33P01593 117 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 IGKV1-33P01594 117 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 G6PCP35575 357 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 SLC38A11Q08AI6 406 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 PRSS8Q16651 343 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 LRP11Q86VZ4 500 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 TDHQ8IZJ6 230 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 OR4X1Q8NH49 305 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 HIST1H2BLQ99880 126 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 CTXN2P0C2S0 81 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 P2RY6Q15077 328 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 SPSB4Q96A44 273 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 OPA3Q9H6K4 179 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 HBG1P69891 147 aa13.02□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 HBG2P69892 147 aa13.02□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 COL10A1Q03692 680 aa13.02□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 ZNF66Q6ZN08 573 aa13.02□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 MCEMP1Q8IX19 187 aa13.02□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 OR8G5Q8NG78 346 aa13.02□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 PCGF1Q9BSM1 259 aa13.02□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 TCFL5Q9UL49 500 aa13.02□□□□□ -0.32
PTPRH-201ENST00000263434 RAMP3O60896 148 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRH-201ENST00000263434 IL2RGP31785 369 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRH-201ENST00000263434 UBE2G2P60604 165 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRH-201ENST00000263434 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
PTPRH-201ENST00000263434 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRH-201ENST00000263434 TECTBQ96PL2 329 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRH-201ENST00000263434 PRSS50Q9UI38 385 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRH-201ENST00000263434 LOC400499M0QZD8 3231 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRH-201ENST00000263434 A0A0U1RQK1 487 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRH-201ENST00000263434 SYNGR4O95473 234 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRH-201ENST00000263434 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
PTPRH-201ENST00000263434 PLGLB1Q02325 96 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRH-201ENST00000263434 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRH-201ENST00000263434 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
PTPRH-201ENST00000263434 TPRX1Q8N7U7 411 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRH-201ENST00000263434 VAX2Q9UIW0 290 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRH-201ENST00000263434 TSTD3H0UI37 97 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRH-201ENST00000263434 CDIPTO14735 213 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRH-201ENST00000263434 CRYAAP02489 173 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRH-201ENST00000263434 CEACAM1P13688 526 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRH-201ENST00000263434 HNF1AP20823 631 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRH-201ENST00000263434 DDTP30046 118 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRH-201ENST00000263434 CHRNA7P36544 502 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRH-201ENST00000263434 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
PTPRH-201ENST00000263434 APH1AQ96BI3 265 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRH-201ENST00000263434 WASF3Q9UPY6 502 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRH-201ENST00000263434 XKRY2A2RUG3 117 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRH-201ENST00000263434 APLNRP35414 380 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRH-201ENST00000263434 OR10A7Q8NGE5 316 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRH-201ENST00000263434 ZDHHC16Q969W1 377 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRH-201ENST00000263434 SDSLQ96GA7 329 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRH-201ENST00000263434 GPR87Q9BY21 358 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRH-201ENST00000263434 H7BYZ3 331 aa13□□□□□ -0.33
PTPRH-201ENST00000263434 YKT6O15498 198 aa13□□□□□ -0.33
PTPRH-201ENST00000263434 DNPH1O43598 174 aa13□□□□□ -0.33
PTPRH-201ENST00000263434 IGHV3-13P01766 116 aa13□□□□□ -0.33
PTPRH-201ENST00000263434 IGHV3-7P01780 117 aa13□□□□□ -0.33
PTPRH-201ENST00000263434 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
PTPRH-201ENST00000263434 ZNF585BQ52M93 769 aa13□□□□□ -0.33
PTPRH-201ENST00000263434 ALKBH2Q6NS38 261 aa13□□□□□ -0.33
PTPRH-201ENST00000263434 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
PTPRH-201ENST00000263434 FGFRL1Q8N441 504 aa13□□□□□ -0.33
PTPRH-201ENST00000263434 TMEM204Q9BSN7 226 aa13□□□□□ -0.33
PTPRH-201ENST00000263434 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa13□□□□□ -0.33
PTPRH-201ENST00000263434 DEFB108AA8MXU0 73 aa13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms