RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 APCSP02743 223 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 MEOX2P50222 304 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 CFHR1Q03591 330 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 WDFY1Q8IWB7 410 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 ZPLD1Q8TCW7 415 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 TINAGQ9UJW2 476 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 GYPAP02724 150 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 PSG2P11465 335 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 HIKESHIQ53FT3 197 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM255AQ5JRV8 349 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 C1QL3Q5VWW1 255 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 PMCHL2Q9BQD1 86 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 PAXXQ9BUH6 204 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 B9A039 149 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 HRKO00198 91 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 TNFSF10P50591 281 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 TOMM20LQ6UXN7 152 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 C5orf17Q8NAS9 161 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 FBLN5Q9UBX5 448 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 DTX4Q9Y2E6 619 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 C17orf51A8MQB3 221 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 OR2A4O95047 310 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 IGHV3-43DP0DP04 118 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 GLI4P10075 376 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 NHLH1Q02575 133 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 NHLH2Q02577 135 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 TSPO2Q5TGU0 170 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 OR2A7Q96R45 310 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 TREM2Q9NZC2 230 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM14DPA8MWL7 114 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 H3BMH7 237 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 UCN2Q96RP3 112 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 CHODLQ9H9P2 273 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 M0R2Z0 102 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 S1PR2O95136 353 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 FABP4P15090 132 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 MPV17P39210 176 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 PIGYQ3MUY2 71 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 FADS6Q8N9I5 356 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 GPA33Q99795 319 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 SLC25A33Q9BSK2 321 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 BMPR1BO00238 502 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 NEURL1O76050 574 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 OR2H2O95918 312 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 LINC00114Q6XXX2 140 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM116Q8NCL8 245 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 OR10AC1Q8NH08 325 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 A8MWL6 223 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 ADAP1O75689 374 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 CD8AP01732 235 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 MPZP25189 248 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 CLEC9AQ6UXN8 241 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 A0A1B0GW15 77 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 H3BQ15 152 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 RPL31P62899 125 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 VAMP3Q15836 100 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 CLEC2AQ6UVW9 174 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 ZFP30Q9Y2G7 519 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 C3orf80F5H4A9 247 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 OR5AL1P0C617 328 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 MAS1LP35410 378 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 RELQ04864 619 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 RFESDQ8TAC1 157 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 OR5P3Q8WZ94 311 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 MRGPRFQ96AM1 343 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 UBTD1Q9HAC8 227 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 FZR1Q9UM11 496 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 CCL21O00585 134 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 ARG1P05089 322 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 MELTFP08582 738 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 COX6B1P14854 86 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM11P17152 192 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 ORM2P19652 201 aa7.8□□□□□ -1.16
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