RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	PFN4	Q8NHR9	129 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	NIPAL2	Q9H841	368 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	ETV7	Q9Y603	341 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	OR2T8	A6NH00	312 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC154	A6NI56	674 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440		K7EP13	123 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	IGKV1D-12	P01611	117 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	IL6	P05231	212 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	MGMT	P16455	207 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF137P	P52743	207 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	CDC42	P60953	191 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	C15orf32	Q32M92	178 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM57B	Q71RH2	274 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	CEP19	Q96LK0	163 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	KCNJ15	Q99712	375 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	MRPL57	Q9BQC6	102 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	OR10A2	Q9H208	303 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	RGCC	Q9H4X1	137 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	IFNK	Q9P0W0	207 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	RHCG	Q9UBD6	479 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A0J9YY99	117 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	3.94	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF44	P15621	663 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	EVI2A	P22794	236 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	3.94	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	MAGEA12	P43365	314 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	CX3CR1	P49238	355 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	DSTN	P60981	165 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	WFDC2	Q14508	124 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	SPA17	Q15506	151 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	ATP6AP1	Q15904	470 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	PRR18	Q8N4B5	295 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	COQ2	Q96H96	371 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	PGAM5	Q96HS1	289 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440		Q96M85	177 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF570	Q96NI8	536 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	C1orf50	Q9BV19	199 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	3.94	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	MED4	Q9NPJ6	270 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM159B	A6NKW6	160 aa		3.93	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	KNCN	A6PVL3	124 aa		3.93	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		3.93	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		3.93	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440		F8VVB4	439 aa		3.93	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440		F8VWA3	439 aa		3.93	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	TAAR5	O14804	337 aa		3.93	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	LANCL1	O43813	399 aa		3.93	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	IGHV3-23	P01764	117 aa		3.93	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	FGG	P02679	453 aa		3.93	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	PRH1	P02810	166 aa		3.93	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	LINC00032	P0C843	101 aa		3.93	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	MPZ	P25189	248 aa		3.93	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	CRABP1	P29762	137 aa		3.93	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC15A1	P46059	708 aa		3.93	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	SERPINB8	P50452	374 aa		3.93	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	ARL4C	P56559	192 aa		3.93	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	PAFAH1B2	P68402	229 aa		3.93	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	CALCOCO2	Q13137	446 aa		3.93	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	OR5I1	Q13606	314 aa		3.93	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	3.93	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		3.93	□□□□□ -1.78

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