RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622362.1

FAM200B-223, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM200B, Length 4,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM200B-223	ENST00000622362	R3HDM4	Q96D70	268 aa		10.25	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	BOD1	Q96IK1	185 aa		10.25	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC22A20	A6NK97	555 aa		10.25	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	PIN1P1	O15428	100 aa		10.25	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	SP1	P08047	785 aa		10.25	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	NPDC1	Q9NQX5	325 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		10.25	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		10.25	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362		A8MXK9	166 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	LMO7DN	F2Z398	122 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	DEDD	O75618	318 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	RBPJ	Q06330	500 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	CST9	Q5W186	159 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	OR6X1	Q8NH79	312 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	C3orf80	F5H4A9	247 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	PSG2	P11465	335 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	RAB37	Q96AX2	223 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	CES1P1	Q9UKY3	287 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362		A0A1B0GU03	582 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	ST8SIA5	O15466	376 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	HAND1	O96004	215 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	ATOH7	Q8N100	152 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	AQP10	Q96PS8	301 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	AMELY	Q99218	206 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	LRRC61	Q9BV99	259 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	FZR1	Q9UM11	496 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	CA2	P00918	260 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	ASB10	Q8WXI3	467 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	CLN8	Q9UBY8	286 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	GALNS	P34059	522 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	CTAG1A	P78358	180 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	LILRA5	A6NI73	299 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	PITX3	O75364	302 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	MOSPD3	O75425	235 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	STAG3L2	P0CL84	134 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	HKR1	P10072	659 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	ZP1	P60852	638 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	LYZ	P61626	148 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	PTX4	Q96A99	478 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	OR2V2	Q96R30	315 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	HTT	P42858	3142 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	MPL	P40238	635 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	SARAF	Q96BY9	339 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	GPHA2	Q96T91	129 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	PROCR	Q9UNN8	238 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362		A0A1W2PN81	502 aa		10.22	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	CDIPT	O14735	213 aa		10.22	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	OR4S2	Q8NH73	311 aa		10.22	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	TBX21	Q9UL17	535 aa		10.22	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	OR2M5	A3KFT3	312 aa		10.22	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	PRF1	P14222	555 aa		10.22	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	CCR5	P51681	352 aa		10.22	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		10.22	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	OR10D3	Q8NH80	312 aa		10.22	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	TIMD4	Q96H15	378 aa		10.22	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		10.22	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		10.22	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	COL4A6	Q14031	1691 aa		10.22	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	CYR61	O00622	381 aa		10.22	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	CXorf1	O96002	111 aa		10.22	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	RELB	Q01201	579 aa		10.22	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		10.22	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	OR2T8	A6NH00	312 aa		10.21	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
FAM200B-223	ENST00000622362	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77

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