RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566882.5

CCNDBP1-210, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 2,746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-210ENST00000566882 LINC00587B1AMM8 73 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 S100A9P06702 114 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 WFDC1Q9HC57 220 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 HES4Q9HCC6 221 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 TREM1Q9NP99 234 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 FBXL17Q9UF56 701 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 MEMO1Q9Y316 297 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 SH2D1BO14796 132 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 GCH1P30793 250 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM33P57088 247 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF718Q3SXZ3 478 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR1L1Q8NH94 360 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 DNTTIP1Q9H147 329 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 CXXC4Q9H2H0 198 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 PIGMQ9H3S5 423 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 TAF9BQ9HBM6 251 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 TREM2Q9NZC2 230 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR2W1Q9Y3N9 320 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 C9JQL5 133 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 ADAM20O43506 726 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 MED6O75586 246 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 ATG12O94817 140 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 KITLGP21583 273 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 FHITP49789 147 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 NHLH2Q02577 135 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 GNMTQ14749 295 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAM201AQ5SY85 155 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 ACP7Q6ZNF0 438 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 DMBX1Q8NFW5 382 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAM57AQ8TBR7 257 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 RNF141Q8WVD5 230 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 COQ2Q96H96 371 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 RNF150Q9ULK6 438 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 ATRXP46100 2492 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 A0A1B0GV50 99 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 F8W036 122 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 MKRN2OSH3BPM6 223 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR8U9P0C7N5 309 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 PSG2P11465 335 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 NFYBP25208 207 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 CCKARP32238 428 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 LINC00205P59089 165 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 BLOC1S1P78537 153 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAM180AQ6UWF9 173 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 DOLPP1Q86YN1 238 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF695Q8IW36 515 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR4D5Q8NGN0 318 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR8U1Q8NH10 309 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 A0A0G2JNJ9 132 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 A0A1B0GW55 424 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM210A6NLX4 147 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 C1QL1O75973 258 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 CRYABP02511 175 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAM87AP0C7U9 286 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 DUX4L2P0CJ85 424 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 DUX4L3P0CJ86 424 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 DUX4L4P0CJ87 422 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 DUX4L5P0CJ88 424 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 DUX4L6P0CJ89 424 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 DUX4L7P0CJ90 424 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 G0S2P27469 103 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 CEACAM6P40199 344 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR3A1P47881 315 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 GLIPR1P48060 266 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 NPBWR1P48145 328 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 TDGF1P3P51864 188 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 AKIRIN2Q53H80 203 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 ETV3LQ6ZN32 361 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 Q8IYB0 196 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 CD177Q8N6Q3 437 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR52L2PQ8NGH6 319 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 LRRC29Q8WV35 223 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 PLPPR2Q96GM1 343 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 C12orf57Q99622 126 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 CABLES2Q9BTV7 478 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 DNAJB11Q9UBS4 358 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 DUX4Q9UBX2 424 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 LPAR3Q9UBY5 353 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 Q9UFV3 132 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 CHD8Q9HCK8 2581 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 C12orf77C9JDV5 145 aa8.52□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 HSPA12AO43301 675 aa8.52□□□□□ -1.04
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