RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530565.5

CTSF-208, Transcript of cathepsin F, humanhuman

TSL 5

Gene CTSF, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSF-208ENST00000530565 GPR157Q5UAW9 335 aa7.01□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 OR13A1Q8NGR1 328 aa7.01□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 OR4K15Q8NH41 348 aa7.01□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 MRGPRDQ8TDS7 321 aa7.01□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 CCDC107Q8WV48 283 aa7.01□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 TNFRSF14Q92956 283 aa7.01□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 PECRQ9BY49 303 aa7.01□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 COPZ2Q9P299 210 aa7.01□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 KLK11Q9UBX7 282 aa7.01□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 NUP50Q9UKX7 468 aa7.01□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 TBC1D24Q9ULP9 559 aa7.01□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 KCNK7Q9Y2U2 307 aa7.01□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa7□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa7□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 MEIOCA2RUB1 952 aa7□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 TMEM235A6NFC5 223 aa7□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa7□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 LYRM1O43325 122 aa7□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 IGHV1-69P01742 117 aa7□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 AKAIN1P0CW23 69 aa7□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 CGB3P0DN86 165 aa7□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 CGB7P0DN87 165 aa7□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 IGHV1-8P0DP01 117 aa7□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 GZMHP20718 246 aa7□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 DTYMKP23919 212 aa7□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 RCVRNP35243 200 aa7□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 TAS2R19P59542 299 aa7□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 GUCA2AQ02747 115 aa7□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 KLRD1Q13241 179 aa7□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 MADCAM1Q13477 382 aa7□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 ARFRP1Q13795 201 aa7□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa7□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 OLFML2AQ68BL7 652 aa7□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 NCR3LG1Q68D85 454 aa7□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 HCP5Q6MZN7 132 aa7□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 HEPN1Q6WQI6 88 aa7□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 Q6ZNX1 250 aa7□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 PDZD9Q8IXQ8 264 aa7□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 CENPSQ8N2Z9 138 aa7□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa7□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 CALYQ9NYX4 217 aa7□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 ZNF69Q9UC07 566 aa7□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 AK3Q9UIJ7 227 aa7□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa7□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 ANAPC10Q9UM13 185 aa7□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 SESN1Q9Y6P5 492 aa7□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa6.99□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa6.99□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 MMP23AO75900 390 aa6.99□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 NAPSAO96009 420 aa6.99□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 CD74P04233 296 aa6.99□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 EPHA1P21709 976 aa6.99□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 OMGP23515 440 aa6.99□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 COX7A1P24310 79 aa6.99□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 SLC6A1P30531 599 aa6.99□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 SSTR5P35346 364 aa6.99□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 UBE2E1P51965 193 aa6.99□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 BPIFB3P59826 476 aa6.99□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 SCGB2A2Q13296 93 aa6.99□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 MEF2DQ14814 521 aa6.99□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 ACTBL2Q562R1 376 aa6.99□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa6.99□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 C6orf183Q5T699 404 aa6.99□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa6.99□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 OR52W1Q6IF63 320 aa6.99□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 STEAP1BQ6NZ63 245 aa6.99□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 TRAT1Q6PIZ9 186 aa6.99□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 BRD3OSQ6XYD6 125 aa6.99□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 Q6ZS49 121 aa6.99□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.99□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 NRARPQ7Z6K4 114 aa6.99□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 HOGA1Q86XE5 327 aa6.99□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 OR13D1Q8NGV5 346 aa6.99□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 KIRREL1Q96J84 757 aa6.99□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 TMEM133Q9H2Q1 129 aa6.99□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 LINC00574Q9H8X3 128 aa6.99□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 HRASLSQ9HDD0 168 aa6.99□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 C12orf4Q9NQ89 552 aa6.99□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa6.99□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa6.98□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 A0A1W2PRD5 423 aa6.98□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 A0A1W2PRF3 423 aa6.98□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 A0A1W2PRM7 423 aa6.98□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 TMEM89A2RUT3 159 aa6.98□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 C12orf77C9JDV5 145 aa6.98□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 C15orf65H3BRN8 121 aa6.98□□□□□ -1.29
CTSF-208ENST00000530565 NPFFO15130 113 aa6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms